使用幽灵细胞计量 (ghost cytometry) 进行高含量细胞表型的聚合CRISPR查
Asako Tsubouchi1, Yuri An1, Yoko Kawamura1
1ThinkCyte Inc., Tokyo 113-8654, Japan.
Cell reports methods
|March 26, 2024
概括
这项研究引入了用于快速聚合CRISPR查的多式幽灵细胞计. 它可以基于光和无标签的表型进行高效的细胞分类,用于大规模的遗传分析.
科学领域:
- 细胞生物学 细胞生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 生物技术是生物技术.
背景情况:
- 基于图像的聚合CRISPR查推进了哺乳动物细胞中的基因型-表型映射.
- 基于形态的快速细胞丰富是高含量查的一个挑战.
- 现有的方法限制了各种细胞表型的大规模基因扰动查.
研究的目的:
- 为了证明多式幽灵细胞计量用于快速聚合的CRISPR查.
- 应用光和无标签的高含量表型用于细胞分类.
- 克服查庞大的细胞群的局限性,以寻找特定的表型.
主要方法:
- 采用多模式幽灵细胞计量与光和无标签模式.
- 执行了针对酶的CRISPR选,使用光向RelA核转位.
- 使用无标签模式对巨细胞两极化基因进行大规模查.
主要成果:
- 成功执行了针对RelA转位的酶特异性CRISPR选.
- 通过无标签查识别了参与巨细胞两极分化的基因.
- 经过证明的无标签丰富,没有侵入性染色,保存细胞用于下游测定.
结论:
- 多模式幽灵细胞计量使得跨多种表型的快速聚合CRISPR查成为可能.
- 无标签的幽灵细胞计扩大了查潜力,特别是当标记物缺席时.
- 这种方法保存了细胞,促进了进一步的下游生物测定.


