HSQC光谱模拟和匹配用于分子识别.
Martin Priessner1, Richard J Lewis2, Magnus J Johansson1
1Medicinal Chemistry, Research and Early Development, Cardiovascular, Renal and Metabolism (CVRM), BioPharmaceuticals R&D, AstraZeneca, Pepparedsleden 1, 43183 Mölndal, Sweden.
本研究介绍了模拟和匹配异核单量子相干 (HSQC) 光谱的先进方法,提高了分子识别和复杂化学结构的数据库搜索精度.
科学领域:
- 化学 化学 化学
- 计算化学计算化学
- 频谱学是一种光谱学.
背景情况:
- 异质核单量子相干 (HSQC) 光谱对于分子指纹识别至关重要.
- 平衡数据丰富性和收集时间对于有效的化合物识别至关重要.
研究的目的:
- 评估和比较四种HSQC光谱模拟技术.
- 开发和评估HSQC数据的峰值匹配和填充策略.
- 增强分子结构阐明和数据库搜索能力.
主要方法:
- 评估了ACD/实验室 (ACD),MestReNova (MNova),高斯NMR (DFT) 和基于图形的神经网络 (ML) 的HSQC模拟.
- 从1DNMR数据 (DFT和ML) 开发了HSQC光谱的重建逻辑.
- 实施和测试的最小和,欧几里德距离和匈牙利距离与零填充,峰值截断和最近邻居填充策略相匹配.
主要成果:
- 结合模拟和匹配策略准确识别了分子,包括区域和立体同位素.
- 实现了快速准确的大规模数据库搜索.
- 通过使用表现最佳的方法,成功地纠正了以前错误识别的分子的结构.
结论:
- 有效的HSQC光谱模拟和匹配有助于显著阐明分子结构.
- 开发的方法为化学研究提供了实际的工具.
- 为研究人员提供Google Colab笔记本,让他们可以将这些方法应用于他们的数据.
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