在使用RNA-Seq的Wanyue Black和约克郡的卵巢转录组的比较分析
Huibin Zhang1,2, Shuo Chen1,2, Yangguang Liu1,2
1College of Animal Science and Technology, Anhui Agricultural University, Hefei 230036, China.
Veterinary sciences
|March 27, 2024
概括
猪品种的遗传差异影响了生殖能力. 沃尼乌黑的雌激素含量较高,约克郡的雌激素含量较高,孕激素和GnRH更高,影响卵巢发育和青春期.
科学领域:
- 动物遗传学动物遗传学
- 生殖生物学 生殖生物学
- 进行比较基因组学.
背景情况:
- 土著的中国Wanyue黑猪和进口的约克郡猪表现出明显的青春期遗传变异.
- 这些变异显著影响子的生殖能力和卵巢发育.
研究的目的:
- 在Wanyue Black和Yorkshire gilts的卵巢转录组中识别差异表达基因 (DEG),基因网络和代谢途径.
- 了解这些猪品种之间的生殖差异背后的遗传和内分泌机制.
主要方法:
- 使用ELISA分析血清激素水平.
- 卵巢基因表达通过RNA测序 (RNA-seq) 来分析.
- 生物信息学分析包括基因本体学 (GO) 和基因和基因组的京都百科全书 (KEGG) 丰富分析.
主要成果:
- 沃尼乌黑的雌激素 (E2) 含量较高; 约克郡的雌激素 (P4) 和淋巴激素释放激素 (GnRH) 的水平较高.
- 在Wanyue黑的卵巢中发现了154个DEG (87个上调,67个下调),与约克郡的卵巢相比.
- DEGs涉及生殖,生殖系统发育,卵巢卵泡发育,类固醇激素生物合成和雌激素/孕产腺素信号通路.
结论:
- 在青春期的Wanyue Black和Yorkshire的卵巢中存在显著的遗传和内分泌差异.
- 确定了9个功能基因,可能会导致卵巢差异.
- 这项研究提供了关于黄金性青春期发育的遗传和内分泌调节的关键见解.
