在小鼠肝脏中识别了与染色质结合的ERRα互动组网络
Charlotte Scholtes1, Catherine Rosa Dufour1, Emma Pleynet1
1Goodman Cancer Institute, McGill University, Montréal, Québec, H3A 1A3, Canada.
Molecular metabolism
|March 27, 2024
概括
与雌激素相关的受体α (ERRα) 与新的蛋白质相互作用,包括HCFC1,以调节细胞能量代谢. 这项研究揭示了控制氧化酸化的新伙伴,影响线粒体呼吸.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 代谢调节 代谢调节 代谢调节
- 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.
背景情况:
- 与雌激素相关的受体α (ERRα) 对于细胞生物能和新陈代谢至关重要.
- ERRα的失调与代谢疾病有关.
- 了解ERRα的核心调节器相互作用对于基因表达控制至关重要.
研究的目的:
- 在小鼠肝脏中绘制染色质结合的ERRα相互作用体图.
- 确定新型ERRα相互作用蛋白及其在代谢调节中的作用.
- 阐明ERRα及其辅因子,特别是HCFC1.1之间的功能相互作用.
主要方法:
- 快速免疫沉内源蛋白质质谱 (RIME) 用于识别小鼠肝染色体中的ERRα相互作用体.
- 分析了染色体免疫沉降测序 (ChIP-seq) 数据,以探索基因组交叉交谈.
- 肝细胞功能丧失研究研究了ERRα和HCFC1.1之间的动态相互作用.
主要成果:
- 确定了48个ERRα的转录相互作用体,其中42个是新型,包括宿主细胞因子C1 (HCFC1).
- ERRα和HCFC1共同占据参与氧化酸化 (OXPHOS) 的基因,特别是在转录起点附近.
- 淘汰研究揭示了ERRα和HCFC1对OXPHOS基因表达和线粒体呼吸的逆调节作用.
结论:
- 这项研究确定了ERRα的一组新型的转录伙伴,包括染色体修饰剂和转录因子.
- 这些发现扩大了对ERRα在调节代谢转录程序中的作用的理解.
- 鉴定到的交互原子为管理细胞能量代谢的复杂调节网络提供了新的见解.
