全球发育迟缓和乌克兰儿童智力障碍的遗传决定因素
Khrystyna Shchubelka1,2, Liudmyla Turova3, Walter Wolfsberger1
1Department of Biological Sciences, Oakland University, 118 Library Drive, Rochester, Yaroslava Hasynets, MI, 48309, USA.
下一代测序 (NGS) 确定了乌克兰15.8%的儿科全球发育迟缓 (GDD) 和智力障碍 (ID) 病例的遗传原因. 这项研究强调了NGS基因面板和整个外体序列 (WES) 作为有价值的诊断工具,特别是在资源有限的环境中.
科学领域:
- 遗传学 遗传学 是一个
- 神经发育障碍 神经发育障碍
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 全球发育迟缓 (GDD) 和智力障碍 (ID) 经常与遗传性疾病有关.
- 下一代测序 (NGS) 已大大推进了导致发育迟缓的基因变异的识别.
- 了解乌克兰等特定人群中GDD/ID的遗传情景对于诊断和管理至关重要.
研究的目的:
- 评估整个外体序列测序 (WES) 和神经发育基因面板测序在乌克兰儿童GDD/ID患者的诊断产量.
- 使用乌克兰人口数据计算预测不确定的意义变异 (VUS) 的影响.
- 建立乌克兰GDD/ID遗传原因的第一个全面数据集.
主要方法:
- 对417名乌克兰儿童的WES或基因组测序数据的回顾性分析.
- 使用CADD-Phred和SIFT预测分数对VUS进行注释.
- 在健康的乌克兰人口中估计VUS频率.
主要成果:
- 在15.8% (66/417) 的队列中,获得了明确的分子诊断.
- 神经发育基因小组的诊断率较高 (12.1%) 与WES相比 (59.4%在一个子集).
- 发育性和性脑病变是最常见的诊断,经常涉及ARX,CDKL5和STXBP1.1等基因. 预计有221例VUS具有破坏性,但在健康人群中发现了18例.
结论:
- NGS基因板和WES是GDD/ID的有效一线诊断工具,特别是在资源有限的环境中,如乌克兰.
- 这项研究提供了乌克兰GDD/ID的第一个全面的遗传调查,提供了有价值的数据集.
- 对VUS分析的综合方法,包括计算预测和人口频率,可以提高诊断产量并指导进一步的家庭测试.
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