一次性单细胞蛋白质组和代谢组分析策略,用于同一个单细胞
Jie Wu1, Qin-Qin Xu1, Yi-Rong Jiang1
1Institute of Microanalytical Systems, Department of Chemistry, Zhejiang University, Hangzhou 310058, China.
Analytical chemistry
|March 28, 2024
概括
我们开发了一种新的一次性单细胞蛋白质组和代谢组分析 (scPMA) 方法. 这种技术可以使用单个LC-MS/MS分析同时对单个细胞进行蛋白质组和代谢组分析,从而推进多分子组研究.
科学领域:
- 生物化学 生物化学
- 分子生物学分子生物学
- 分析化学 分析化学
背景情况:
- 单细胞多原子研究需要强大的方法来同时表征蛋白质组和代谢组.
- 目前的技术往往面临着在单细胞水平上进行双组体分析的吞吐量和灵敏度的限制.
研究的目的:
- 引入一种新的策略,即一次性单细胞蛋白质组和代谢组分析 (scPMA),用于单个细胞的综合蛋白质组和代谢组分析.
- 通过LC-MS/MS建立一个全面的工作流程,用于通过LC-MS/MS捕获单细胞,准备样本和采集双组数据.
主要方法:
- 对单细胞的一次性分析的scPMA策略的开发.
- 实施工作流程,包括单细胞捕获,纳米升级预处理和单次LC-MS/MS注射.
- 使用双区域MS/MS检测,同时进行蛋白质组和代谢组分析.
主要成果:
- 成功应用scPMA分析单个瘤细胞 (A549,HeLa,HepG2),分别定量平均816,578和293个蛋白质组.
- 分别为A549,HeLa和HepG2细胞量化了平均72,91和148种代谢物.
- 在蛋白质和代谢水平上对多克索鲁比诱导的抗瘤作用的研究中证明了scPMA的实用性.
结论:
- scPMA策略提供了一个强大的工具,用于在单细胞水平上进行高通量,双氧分析.
- 这种方法通过使综合蛋白质组和代谢组的表征能够显著推进单细胞多原子研究.
- scPMA为了解复杂生物系统中细胞异质性和对刺激的反应开辟了新的途径.
