shinyMBA:一种新的R shiny应用程序,用于用于血清监测研究的多重珠子试验的质量控制
Zachary Matson1, Gretchen Cooley2, Nishanth Parameswaran2
1Viral Vaccine Preventable Diseases Branch, Division of Viral Diseases, National Center for Immunization and Respiratory Diseases, Centers for Disease Control and Prevention, Atlanta, GA, USA. zmatson@cdc.gov.
Scientific reports
|March 29, 2024
概括
一个新的R Shiny应用程序,shinyMBA,简化了用于大规模血清检测的多重珠测试 (MBA) 的质量控制. 这种工具提高了数据的准确性,并加快了对多个抗原的人口免疫力的评估.
科学领域:
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 生物信息学是一种生物信息学.
- 公共卫生 公共卫生
背景情况:
- 使用Luminex xMAP技术的多重珠子测定 (MBA) 对于血清调查中的人口免疫评估至关重要.
- 对多重抗原进行质量控制 (QC) 的评估是复杂的,因为每个抗原有多个参数.
- 对质量控制失败的大型MBA数据集的分析为实验室带来了重大挑战.
研究的目的:
- 开发一个自动化的R Shiny应用程序,shinyMBA,以加快多重珠子试验质量控制.
- 为了减少用户错误,提高QC评估在大规模血清检测的效率.
- 为提供一个工具,用于同时评估珠数,中位数光强度 (MFI) 和测试对照.
主要方法:
- 开发一个新的R闪亮的应用程序,闪亮MBA.
- 统计过程控制图的整合,用于同时评估QC参数.
- 使用合成数据和真实世界血清监测研究来测试应用程序.
主要成果:
- shinyMBA 能够快速合并多板测试输出,以进行全面的 QC 分析.
- 该应用程序有效评估多个抗原的珠数,MFI和测试控制性能.
- 使用合成数据和两项涉及多达20个多重抗原的大型血清监测研究证明了效用.
结论:
- shinyMBA显著提高了基于Luminex的血清监控工作流程中质量控制的速度和准确性.
- 该开源应用程序促进了更广泛的采用和修改,以满足各种实验室需求.
- 结合shinyMBA可以提高来自血清调查的人口免疫数据的可靠性.
