无标签的内源性的量化方法
Md Shadman Ridwan Abid1, Haowen Qiu2,3, James W Checco4,5
1Department of Chemistry, University of Nebraska-Lincoln, Lincoln, NE, USA.
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
|March 29, 2024
概括
本研究介绍了一种使用液体染色体质谱法 (LC-MS) 的无标签定量体学方法. 工作流处理运行到运行的变性,以便在生物样本中进行准确的丰度比较.
科学领域:
- 生物化学 生物化学
- 分析化学 分析化学
- 蛋白质组学是指蛋白质组学.
背景情况:
- 液体染色学-质谱学 (LC-MS) 能够在复杂的生物混合物中进行非目标检测和的识别.
- 定量组学允许对丰度进行比较分析,这对于理解对治疗或生理变化的生物反应至关重要.
- 由于质谱仪表和分析工具的进步,无标签的定量方法越来越受欢迎,为稳定同位素标签提供了替代方案.
研究的目的:
- 为无标签的定量基体实验概述一个一般的方法.
- 为研究人员提供一个框架,以开发他们自己的定量体学工作流程.
- 为了能够准确量化来自各种生物来源的.
主要方法:
- 详细描述样本准备,LC-MS数据采集,数据处理和统计分析,用于无标签的定量类药物.
- 强调减轻运行到运行变化的策略,这是无标签实验中的一个关键挑战.
- 利用峰值强度信息在多个LC-MS运行中进行类比较.
主要成果:
- 介绍了一份关于无标签定量类药物的综合方法框架.
- 这种方法可方便在样本之间对丰度进行可靠的比较.
- 该方法适用于广泛的生物来源.
结论:
- 开发的方法为无标签的定量组学提供了可靠的框架.
- 这种方法使研究人员能够在各种生物环境中研究丰度差异.
- 该工作流适用于从各种生物材料中定量.


