使用TCGA数据库和临床标本,研究头角状细胞癌中长非编码RNA的诊断潜力
Ting Lan1, Yuxiang Yan1, Dali Zheng2
1Fujian Key Laboratory of Oral Diseases, Fujian Biological Materials Engineering and Technology Center of Stomatology, School and Hospital of Stomatology, Fujian Medical University, 88 Jiao Tong Road, Fuzhou, 350004, Fujian, China.
Scientific reports
|March 30, 2024
概括
四个长非编码RNAs (lncRNAs) 显示为头部和部状细胞癌 (HNSCC) 的诊断生物标志物具有前途. 这些lncRNA与预后不佳有关,可能会影响HNSCC的免疫反应.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 分子生物学分子生物学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 头部和部状细胞癌 (HNSCC) 对全球健康构成重大挑战.
- 长非编码RNAs (lncRNAs) 越来越多地被认为是它们在癌症发育和调节中的作用.
研究的目的:
- 确定具有诊断潜力的新型长非编码RNA (lncRNAs) 作为头部和部状细胞癌 (HNSCC) 的生物标志物.
- 调查在HNSCC.中发现的lncRNAs的预后价值和功能作用.
主要方法:
- 利用癌症基因组图谱 (TCGA) 数据库对HNSCC中的lncRNA表达数据进行统计分析.
- 使用实时定量逆转录聚合酶链反应 (RT-qPCR) 验证了候选 lncRNA,并将它们与临床因素相关联.
- 构建了一个lncRNA-mRNA调节网络,以探索功能途径和免疫微环境相互作用.
主要成果:
- 在HNSCC中鉴定出488个差异表达的lncRNA,优先考虑24个进行进一步研究.
- 已确定LINC00460,LINC00941,CTC-241F20.4和RP11-357H14.17作为具有高精度的候选诊断生物标志物.
- 发现这些lncRNAs与预后不佳,晚期表达升高以及在HNSCC微环境中调节免疫细胞透有关.
结论:
- 在LINC00460,LINC00941,RP11-357H14.17和CTC-241F20.4中显示出HNSCC的显著诊断和预后潜力.
- 这些lncRNAs可能在HNSCC进展,免疫反应和微环境相互作用中发挥关键作用.
- 对这些lncRNA的进一步研究可能会导致改善HNSCC的诊断和治疗策略.
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