GWAS-Informed数据整合和非编码的CRISPRi屏幕揭示了骨矿物质密度的遗传病因

科学领域:

• 遗传学 遗传学 是一个
• 基因组学就是基因组学.
• 骨生物学 骨生物学 骨生物学

背景情况:

• 全基因组关联研究 (GWAS) 已经确定了1100多个与骨矿物质密度 (BMD) 相关的遗传位置.
• 鉴定这些关联的特定基因和监管元素仍然是一个重大挑战.
• 骨损伤是影响脆弱性骨折和死亡率的关键因素.

研究的目的:

• 使用功能基因组学方法识别调节骨矿物质密度 (BMD) 的效应基因.
• 调查BMD GWAS loci. 的非编码监管元素的作用.
• 为了探索BMD相关遗传信号的潜在类效应.

主要方法:

• 一个变异对基因映射策略确定了89个候选监管元素.
• 在人类胎儿骨质母细胞 (hFOB) 中进行了单细胞CRISPR干扰 (CRISPRi) 选.
• 使用siRNA淘汰和评估骨质细胞成熟和矿化来验证基因功能.

主要成果:

• 克里斯皮尔屏幕扰乱了23个基因,使它们与BMD调节有关.
• 四个基因 - - ARID5B,CC2D1B,EIF4G2和NCOA3 - - 始终影响骨质细胞的成熟和矿化.
• 遗传性丰富分析表明,许多BMD GWAS信号是类的,并通过非骨组织起作用.

结论:

• ARID5B,CC2D1B,EIF4G2和NCOA3是骨质母细胞功能和骨髓瘤的关键调节者.
• 该研究强调了 BMD 监管中非编码元素的重要性.
• 将CRISPRi查扩展到非骨组织对于全面了解BMD病因学至关重要.