智利患者基因组分析怀疑有雷特综合征:保持广泛的差异诊断
Florencia Brito1, Catalina Lagos1, Jessica Cubillos2
1Rare Diseases Program, Center for Genetics and Genomics, Institute of Sciences and Innovation in Medicine, Facultad de Medicina, Clínica Alemana Universidad del Desarrollo, Santiago, Chile.
Frontiers in genetics
|April 3, 2024
概括
基因组测试证实了超过三分之一的智利患者患有雷特综合征 (RTT),而其他人则接受了其他神经发育诊断. 本试点研究表明,在资源有限的环境中,RTT的可行诊断方法.
科学领域:
- 遗传学 是一个遗传学.
- 神经学 神经学
- 罕见疾病 罕见疾病
背景情况:
- 雷特综合征 (RTT) 是一种罕见的遗传疾病,导致发育回归,主要是由于MECP2基因变异.
- 由于基因组测试资源稀缺,拉丁美洲的RTT分子诊断往往是有限的.
- 这项研究解决了智利RTT患者分子表征的需求.
研究的目的:
- 实施基因组测试,对智利的一群疑似RTT.患者进行基因组测试.
- 描述这个患者组的临床和分子发现.
- 评估在资源有限的环境中逐步基因组测试方法的可行性.
主要方法:
- 28名疑似RTT患者的表型特征.
- 使用临床外体溶液 (CES_V2) 的分子测试由SOPHiA遗传学.
- 使用SOPHiA DDMTM进行生物信息学分析,其中包括34个基因组和整个外基因组测序.
主要成果:
- 在11名患有致病性/可能致病性 (P/LP) MECP2变异的患者 (39.2%) 中确认了RTT诊断.
- 在4名患者 (14.2%) 中发现了其他基因 (GRIN2B,MADD,TRPM3,ZEB2) 的P/LP变异,导致了其他神经发育诊断.
- 大约一半的参与者获得了分子诊断,其他人的结果是不确定的或负面的.
结论:
- 基因组测试在很大一部分智利患者中成功诊断出RTT,并确定了其他神经发育障碍.
- 这项研究证明了在资源有限的环境中逐步实施基因组测试策略的可行性.
- 对于具有负面或不确定的遗传发现的患者,需要进一步调查.


