塔克曼 (Taqman) PACMAN:一种简单的分子方法,在患病率低的时期,用于积极的快速抗原测试确认
Gregory R McCracken1, Glenn Patriquin1,2, Todd F Hatchette1,2,3,4
1Division of Microbiology, Department of Pathology and Laboratory Medicine, Nova Scotia Health, Halifax, Nova Scotia, Canada.
Microbiology spectrum
|April 3, 2024
概括
对SARS-CoV-2的快速抗原测试需要通过分子测试进行确认. 没有核酸提取的简化PCR方法被证明是准确且具有成本效益的,用于确认阳性抗原测试,支持更广泛的部署.
科学领域:
- 临床诊断 临床诊断 临床诊断
- 分子生物学分子生物学
- 传染病流行病学 传染病流行病学
背景情况:
- 在疫情期间,基于抗原的快速诊断测试 (Ag-RDTs) 对SARS-CoV-2测试至关重要.
- 国家指导方针建议在低患病率的环境中进行积极的Ag-RDTs的确认分子测试.
- 对确认性测试的高需求使临床实验室资源受到压力.
研究的目的:
- 评估没有核酸提取 (NAE) 的实时RT-PCR的灵敏度和准确性,以确认阳性Ag-RDT结果.
- 评估无NAERT-PCR对实验室资源的影响,包括时间,人员和成本.
- 模拟SARS-CoV-2流行对实验室资源需求对Ag-RDT确认的影响.
主要方法:
- 对比Ag-RDT和核酸放大测试 (NAAT) 来自无症状测试场所的结果.
- 使用NAAT阳性个体和Ag-RDT阳性个体的样本分析了带有和没有NAE的实时RT-PCR.
- 计算的每周假阳性率 (FPR) 和假检测率 (FDR).
- 对无NAE和包括NAE的RT-PCR进行模拟的实验室资源要求.
主要成果:
- 在无症状测试地点的整体FPR低 (0.07%),但错误检测率 (FDR) 高 (30.7%).
- 有和没有NAE的实时RT-PCR显示与NAAT阳性标本100%一致.
- 无NAE的RT-PCR显著减少了回报时间,人力资源和成本.
- 30.7%的FDR强调了在低流行环境中对阳性Ag-RDTs的NAAT-based确认的必要性.
结论:
- 无NAE实时RT-PCR是一种敏感,准确和具有成本效益的方法,用于确认阳性SARS-CoV-2Ag-RDT结果.
- 实施无NAE的RT-PCR支持持续的确认测试和更广泛的Ag-RDT部署.
- 这种方法优化了实验室工作流程和传染病诊断的资源配置.
