一个基于与瘤微环境相关的基因建立的预后签名,用于肝细胞癌患者
Zhongfeng Cui1, Ge Li1, Yanbin Shi2
1Department of Clinical Laboratory, Henan Provincial Infectious Disease Hospital, Zhengzhou 450000, China.
Aging
|April 5, 2024
概括
这项研究确定了与瘤微环境相关的基因 (TRG),以将肝细胞癌 (HCC) 患者分类为亚型并预测预后. 使用这些TRG的风险评分模型有助于个性化HCC治疗策略.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 瘤微环境 (TME) 在肝细胞癌 (HCC) 进展中起着至关重要的作用.
- 在TME内的复杂的细胞信号网络可以作为HCC患者的预后指标.
研究的目的:
- 在TME中识别预后生物标志物用于HCC患者分类.
- 开发一种风险评分模型,用于预测HCC的预后,并指导个性化治疗.
主要方法:
- 使用单变Cox回归对预后相关的TME相关基因 (TRG) 的查.
- 使用非负矩阵因子化 (NMF) 将HCC样本分组为分子亚型.
- 使用LASSO和考克斯回归分析 (CRA) 开发风险评分 (RS) 模型,通过名图,ROC曲线,C指数和决策曲线分析进行验证.
主要成果:
- 根据704个TRG,确定了三种分子HCC亚型 (C1,C2,C3),C1亚型显示出明显更好的整体存活率 (OS).
- 用13个TRG构建的风险评分模型独立预测了患者的预后.
- 风险评分与免疫细胞透有显著的相关性,包括CD8+ T细胞,单细胞系和髓状树突细胞.
结论:
- 识别的TRG和开发的风险评分模型可以有效地分类HCC患者并预测他们的预后.
- 这种分类和预测方法有助于开发针对HCC的个性化治疗策略.
