整体转录组测序的综合分析揭示了使用FGF21治疗肺高血压的CeRNA调节网络

科学领域:

• * 分子生物学 * 分子生物学
• * 基因组学 是一个学科.
• *RNA生物学 *RNA生物学

背景情况:

• * 非编码RNA在低氧性肺高血压 (HPH) 中至关重要.
• * 纤维细胞生长因子21 (FGF21) 显示出减轻HPH的潜力.
• *了解FGF21在HPH中的分子机制至关重要.

研究的目的:

• * 研究用FGF21.21治疗的小鼠HPH模型中的全转录组RNA表达和相互作用.
• * 识别差异表达RNA并构建ceRNA网络.
• *阐明FGF21在HPH病原和治疗效果中的作用.

主要方法:

• * 全转录组测序 (mRNAs,miRNAs,lncRNAs,circRNAs) 在normoxia,hypoxia和hypoxia + FGF21组中.
• *交叉分析和预测数据库,用于识别差异共同表达的RNA.
• *功能丰富分析,ceRNA网络构建和定量实时PCR验证.
• * 露西法酶记者测定以确认特定的RNA相互作用.

主要成果:

• *已识别出通过低氧和FGF21调节的差异表达的mRNA,miRNA,lncRNA和cirRNA.
• * 丰富的途径包括MAPK信号和表观遗传修饰,表明它们在FGF21的治疗作用中的作用.
• *构建了lncRNA-miRNA-mRNA和circRNA-miRNA-mRNA ceRNA网络,突出了miR-449c-5p作为一个潜在的关键调节器.
• *经验证的RNA表达数据和证实了涉及miR-449c-5p的相互作用.

结论:

• *FGF21的使用会影响HPH中的多种RNA类型,影响关键的信号和表观遗传通路.
• *确定了用FGF21.21治疗HPH的潜在生物标志物和ceRNA调节网络.
• * miR-449c-5p被建议作为FGF21介导的HPH治疗中的关键调节剂.
• *这些发现为FGF21在肺高血压中的临床应用提供了实验基础.