对DEN和CCl4诱导的肝细胞癌小鼠模型的蛋白质组分析
Qian Zhang1, Yuhui Liu1, Liangliang Ren1
1State Key Laboratory of Medicle Proteomics, Beijing Institute of Lifeomics, Beijing Proteome Research Center, National Center for Protein Sciences (Beijing), Beijing, 102206, China.
Scientific reports
|April 5, 2024
概括
这项研究提供了一个详细的蛋白质概况的甲胺 (DEN) 和四化碳 (CCl4) 诱导的肝细胞癌 (HCC) 鼠标模型. 结果揭示了关键蛋白质的变化,并确定了人类HCC的潜在预后标志物.
科学领域:
- 生物化学 生化学
- 分子生物学分子生物学
- 在瘤学瘤学.
背景情况:
- 肝细胞癌 (HCC) 构成严重的全球健康负担,通常是由肝纤维化和肝硬化引起的.
- 已建立的二甲基胺 (DEN) 和四化碳 (CCl4) 诱导的小鼠模型密切模仿HCC的病理特征,包括纤维化和炎症,这使得它们对研究至关重要.
- 目前缺乏对这种HCC小鼠模型中蛋白质表达格局的全面了解.
研究的目的:
- 对DEN和CCl4诱导的HCC小鼠模型进行蛋白质组分析,以描述其蛋白质表达特征.
- 在这个模型中,确定关键的蛋白质变化和参与HCC发展的途径.
- 通过比较蛋白质组数据与人类队列来评估小鼠模型对人类HCC的翻译相关性.
主要方法:
- 在DEN和CCl4诱导的HCC小鼠模型中的瘤和正常肝脏组织上进行了蛋白质组分析.
- 生物信息分析,包括基因本体学 (GO),发明路径分析 (IPA),蛋白质蛋白相互作用 (PPI) 网络和基因组丰富分析 (GSEA),应用于差异表达蛋白质 (DEP).
- 从小鼠模型中获得的DEP与人类HCC队列中的同类蛋白质进行了比较,并整合了临床数据以确定预后标志物.
主要成果:
- 与正常肝脏组织相比,瘤组织中共鉴定了432种差异表达蛋白 (DEP),其中365种是上调调节的67种是下调调节的.
- 确定的主要区分特征是actin细胞骨的上调调节和分支链氨基酸的代谢重编程.
- 鼠标模型的蛋白质组形状与与预后不佳的人类HCC亚型相似,并确定了7种蛋白质 (SMAD2,PTPN1,PCNA,MTHFD1L,MBOAT7,FABP5,AGRN) 具有预后意义.
结论:
- 这项研究为DEN和CCl4诱导的HCC小鼠模型提供了宝贵的蛋白质组数据,增强了它在HCC研究中的实用性.
- 鉴定的蛋白质变化和途径为HCC病变的产生提供了洞察力.
- 这些发现支持该模型的翻译相关性,并突出了人类HCC的潜在预后生物标志物.
