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Updated: Jun 29, 2025
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The Lambda Select cII Mutation Detection System
Published on: April 26, 2018
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在2D和3DHepaRG细胞培养中评估N-二甲基胺的变异性,使用经过错误纠正的下一代测序
Ji-Eun Seo1, Yuan Le1, Javier Revollo1
1Division of Genetic and Molecular Toxicology, National Center for Toxicological Research, U.S. Food and Drug Administration, Jefferson, AR, 72079, USA.
Archives of toxicology
|April 7, 2024
概括
2D和3D格式的人类HepaRG细胞使用彗星,微核和错误纠正下一代测序试验有效检测基因毒性和突变发生. 3D球形对N-尼托罗斯二甲基胺 (NDMA) 暴露的敏感性更大.
科学领域:
- 毒理学 毒理学 毒理学
- 遗传学 是一个遗传学.
- 细胞生物学 细胞生物学
背景情况:
- 人类肝脏衍生HepaRG细胞在2D和3D格式的基因毒性测试中具有价值.
- 像彗星和微核测试这样的既定测试可以检测DNA和染色体损伤.
研究的目的:
- 扩大HepaRG细胞的基因毒性终点,通过使用错误纠正下一代测序 (ecNGS) 评估突变发生.
- 为了比较2D和3DHepaRG细胞模型在检测N-二甲基胺 (NDMA) 诱导的基因毒性和突变发生的性能.
主要方法:
- 肝炎RG细胞 (2D和3D球形) 被暴露在N-二甲基胺 (NDMA) 上.
- 用彗星试验 (DNA损伤) 和微核 (MN) 试验 (染色体损伤) 评估基因毒性.
- 使用双重测序 (DS) 和高保真性 (HiFi) 测序 (ecNGS) 评估了突变发生.
主要成果:
- 在2D和3D培养中,NDMA诱导的细胞毒性,DNA损伤,MN形成和突变频率的度依赖性增加.
- 与2D细胞相比,3D球形对NDMA表现出更大的敏感性.
- 突变谱分析显示,主要是NDMA诱导的A:T → G:C转换.
结论:
- HepaRG 2D 和 3D 模型适用于使用 DS 和 HiFi 测序进行突变发生的评估.
- 3D球体为基因毒性测试提供了增强的灵敏度.
- 赫帕RG 2D/3D 系统显示出作为基因毒性测试的人类平台的潜力,对于高细胞毒性DS建议谨慎使用.
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