用响应表面方法和人工神经网络建模来优化Salsola laricifolia原质的制备条件
Hao Guo1,2,3, Yuxin Xi1,4,5, Kuerban Guzailinuer1,5,6
1State Key Laboratory of Desert and Oasis Ecology, Key Laboratory of Ecological Safety and Sustainable Development in Arid Lands, Xinjiang Institute of Ecology and Geography, Chinese Academy of Sciences, Urumqi, 830011, China.
这项研究利用响应表面方法 (RSM) 和人工神经网络 (ANN) 模型优化了从Salsola laricifolia中分离出原质细胞. 优化的方法为S. laricifolia基因功能研究提供了一个高效的单细胞系统.
科学领域:
- 植物生物技术 植物生物技术
- 分子生物学分子生物学
- 沙漠生态 沙漠生态
背景情况:
- 萨尔索拉·拉里西福利亚 (Salsola laricifolia) 是来自阿马兰太家族的C3-C4型沙漠植物,它需要一个高效的单细胞系统来进行基因功能研究.
- 之前的研究是优化实验条件的基础.
研究的目的:
- 为了优化Salsola laricifolia的原生细胞隔离条件.
- 评估响应表面方法 (RSM) 和人工神经网络 (ANN) 模型在优化原生质准备中的有效性.
- 为未来的遗传实验建立一个高效的单细胞系统.
主要方法:
- 使用Box-Behnken实验设计来优化条件.
- 使用响应表面方法 (RSM) 和人工神经网络 (ANN) 模型来分析实验因素.
- 原生质的产量,活力和活性的细胞数量是关键的评估指标.
- 参考基因 (18SrRNA,β-actin,EF1-α) 在原生质中进行了表达选.
- 使用pBI121-SaNADP-ME2-GFP等离子体进行了PEG介导的转化.
主要成果:
- 确定了原始质细胞产量 (1.550 × 10^6/100毫克) 的最佳条件,其生存率为90.65%,生存细胞为1.405 × 10^6/100毫克.
- 细胞酶R-10含量是最有影响力的原始质细胞产量因素,而酶R-10含量最影响活力.
- RSM模型在预测产量和活力方面表现出色,而ANN在预测活力细胞数量方面表现出改善.
- 确定β-actin和EF1-α是适合原生体实验的内部参考基因.
- SaNADP-ME2被定位在叶绿体中.
结论:
- 对于S. laricifolia,RSM和ANN模型有效优化了原生质的准备.
- 开发的方法可以适应从其他植物材料中分离原生质.
- 这项研究为S. laricifolia遗传研究提供了一种经过验证,高效的单细胞系统.
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