一种化学蛋白质学方法,用于对活细胞的细胞表面上的功能性溶酶进行全球映射
Ting Wang1, Shiyun Ma1, Guanghui Ji1
1Liver Cancer Institute, Zhongshan Hospital and Department of Chemistry, Fudan University, Shanghai, China.
Nature communications
|April 8, 2024
概括
研究人员开发了一种新的化学探针和策略,用于绘制细胞表面溶酶的地图,确定了2600多个部位. 这种方法揭示了用于治疗开发的细胞表面的新药点.
科学领域:
- 生物化学 生物化学
- 化学生物学 化学生物学
- 蛋白质组学是指蛋白质组学.
背景情况:
- 细胞表面蛋白对于生理作用至关重要,并代表主要的药物标.
- 由于它们的细胞环境,准膜蛋白具有挑战性,阻碍了连接体的发现.
研究的目的:
- 开发一种新的化学蛋白质分子探针和分析细胞表面蛋白质功能的策略.
- 创建细胞表面氨酸位点的综合数据集,并识别用于药物发现的高度反应性残留物.
主要方法:
- 一个新的化学蛋白质原子探针OPA-S-S-alkyne的设计和合成.
- 表面功能的全球分析 (GASF) 策略在活的Hela细胞中的应用.
- 细胞表面 lysines 的量化和超反应性残留物的识别.
主要成果:
- 在Hela细胞中量化了2639个细胞表面溶酶,建立了迄今为止最大的数据集.
- 在细胞表面发现了几百种高度反应的氨酸残留物.
- 在ROR2上验证了K382,在ENG/CD105上验证了K285作为关键交互接口站点.
结论:
- 开发的GASF策略和化学探测器使得细胞表面 lysines 的有效和选择性向.
- 超反应性溶酶的鉴定为蛋白质相互作用和功能后果提供了新的见解.
- 这种方法具有显著的潜力,可以在细胞表面发现新的,可结合的药物标.
