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Automated Robotic Liquid Handling Assembly of Modular DNA Devices
Published on: December 1, 2017
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在流动机器人ONE液体处理机器人上对全基因组测序应用程序自动化Illumina DNA库准备套件
Erin Meijers1, Fabienne B Verhees1, Dennis Heemskerk1
1Department of Medical Microbiology, Leiden University Medical Center, Albinusdreef 2, 2333 ZA, Leiden, The Netherlands.
Scientific reports
|April 8, 2024
概括
在流动机器人ONE机器人上自动化全基因组测序库准备 (LP) 显著减少了动手时间 (HOT) 并提高了可重复性. 这种自动化工作流程确保了与手工方法可比的结果,提高了临床诊断效率.
科学领域:
- 基因组学就是基因组学.
- 分子生物学分子生物学
- 临床诊断 临床诊断 临床诊断
背景情况:
- 全基因组测序 (WGS) 正在过渡到常规的临床诊断.
- 图书馆准备 (LP) 是WGS的一个关键,劳动密集型的步骤.
- 手动LP容易出现人为错误,需要大量的实践时间 (HOT).
研究的目的:
- 使用流程机器人ONE机器人自动化Illumina DNA Prep库准备工作流程.
- 为了最大限度地减少人为错误和减少手动时间 (HOT) 在WGS图书馆准备.
- 评估LP自动化工作流程的可靠性,可重复性和效率.
主要方法:
- 流动机器人ONE机器人被编程并优化为自动化Illumina DNA准备.
- 16个图书馆准备手动和自动进行比较.
- 通过使用自动化工作流重新处理8个图书馆准备来评估可重复性.
主要成果:
- 自动和手动LP显示了可比的图书馆DNA产量 (中位数为1.5倍的差异).
- 在自动化和手动方法之间,组装质量值是相似的.
- 在核心基因组多部位序列类型化结果中观察到100%的一致性.
- 手动时间 (HOT) 从125分钟 (手动,8个LPs) 减少到25分钟 (自动,8个LPs).
- 自动化工作流程 (170分钟) 的交付时间比手动工作流程 (200分钟) 缩短了.
结论:
- 自动化流程机器人ONE工作流程为WGS库准备提供一致和可重复的结果.
- 与手动方法相比,自动化显著减少了动手时间 (HOT) 和周转时间.
- 自动化LP是临床诊断WGS工作流程的可靠替代方案.
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