用生物信息分析和实验验证识别参与大动脉剖析的关键免疫透相关基因

科学领域:

• 免疫学 免疫学 免疫学
• 血管生物学 血管生物学
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• 免疫微环境显著影响大动脉解剖 (AD).
• 识别新的免疫生物标志物对于AD预防,诊断和治疗至关重要.
• 了解AD病变的潜在免疫机制是必不可少的.

研究的目的:

• 确定关键的免疫相关基因,并阐明它们在AD病变发生过程中的机制.
• 发现潜在的免疫生物标志物用于AD诊断和治疗.
• 研究免疫细胞在AD发展中的作用.

主要方法:

• 单样样本基因组丰富分析 (ssGESA) 用于识别AD中的关键免疫细胞.
• 权重基因联合表达网络分析 (WGCNA) 用于选与关键免疫细胞相关的基因.
• 蛋白与蛋白相互作用 (PPI) 网络分析以确定枢纽免疫基因.
• 在独立的队列中验证诊断潜力,并使用RT-PCR,免疫组织化学和西式斑点分析进行表达分析.

主要成果:

• 艾滋病的关键免疫细胞包括激活的B细胞,CD56dim自然杀手细胞,乙氨基,玛三角形T细胞,不成熟的B细胞,自然杀手细胞和17型T辅助细胞.
• 十个与枢纽免疫细胞相关的基因 (KDR,IGF1,NOS3,PECAM1,GAPDH,FLT1,DLL4,CDH5,VWF,TEK) 被确定为AD的潜在诊断标志物.
• 减少VWF (von Willebrand因子) 的表达在mRNA和蛋白质水平上被验证为AD.
• VWF表达与ACTA2 (平滑肌肉细胞标记物) 呈正相关性,并在大动脉组织中与ACTA2结合,表明VWF在AD中平滑肌肉细胞丧失中的作用.

结论:

• 确定了关键免疫细胞和与AD病变发生相关的核心免疫细胞相关的基因.
• ·威尔布兰德因子 (VWF) 被确定为阿尔茨海默病的潜在诊断标记物.
• 与ACTA2共同表达的VWF表明它在AD病变发生过程中在光滑肌肉细胞损失中起着重要的作用.