使用RT-qPCR和胡淡斑病毒正常化方法在废水中纵向量化SARS-CoV-2RNA的协议
Bryan Sanchez Jimenez1, Trinity Sterling2, Austin Brown2
1Department of Health Sciences, Stetson University, 421 N Woodland Boulevard, DeLand, FL 32723, USA; Department of Microbiology and Immunology, New York Medical College, 40 Sunshine Cottage Road, Valhalla, NY 10595, USA.
STAR protocols
|April 10, 2024
概括
这项研究详细介绍了一项废水监测协议,用于通过RT-qPCR和PMMoV正常化跟踪严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2 (SARS-CoV-2) 感染水平. 该方法可以在社区中对病毒RNA进行纵向监测.
科学领域:
- 环境微生物学环境微生物学
- 病毒学 病毒学
- 公共卫生 公共卫生
背景情况:
- 污水监测是监测社区传染病爆发的宝贵工具.
- 在废水中追踪严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2 (SARS-CoV-2) RNA,可以了解感染动态.
- 标准化协议对于可靠和可重复的基于废水的流行病学至关重要.
研究的目的:
- 详细介绍一项用于废水中SARS-CoV-2RNA的纵向量化方案.
- 建立一种使用定量逆转录PCR (RT-qPCR) 和胡温和斑点病毒 (PMMoV) 规范化的可靠方法.
- 为社区级病毒监测提供框架.
主要方法:
- 采样和消毒. 采样和消毒.
- 固体分离,超过,以及病毒沉/度.
- 通过RNA提取,RT-qPCR,病毒度抽取和PMMoV正常化.
主要成果:
- 为废水中SARS-CoV-2RNA量化开发了一个全面的协议.
- 该方法允许对病毒RNA水平进行纵向分析.
- PMMoV正常化提高了SARS-CoV-2度估计的准确性.
结论:
- 本协议为SARS-CoV-2废水监测提供了一种标准化的方法.
- 该方法可以适应在废水中监测其他病毒病原体.
- 有效的废水监测有助于公共卫生准备和反应.
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