转移性癌症中的微生物组的泛癌分析
Thomas W Battaglia1, Iris L Mimpen2, Joleen J H Traets3
1Division of Molecular Oncology & Immunology, the Netherlands Cancer Institute, Amsterdam 1066 CX, the Netherlands; Division of Molecular Carcinogenesis, the Netherlands Cancer Institute, Amsterdam 1066 CX, the Netherlands; Oncode Institute, the Netherlands Cancer Institute, Amsterdam 1066 CX, the Netherlands.
转移性瘤微生物组包含特定器官的微生物,并影响癌症,影响免疫治疗的反应. 了解这种复杂的生态系统是开发新抗癌疗法的关键.
科学领域:
- 微生物组研究
- 癌症生物学
- 免疫学
背景情况:
- 微生物群落居住在人体各个部位, 调节免疫力和抗癌疗法的反应.
- 最近的研究表明,主要瘤中存在复杂的微生物群落.
- 微生物组在转移性瘤中的作用在很大程度上仍未被探索.
研究的目的:
- 在转移性瘤中调查微生物组的存在和相关性.
- 确定微生物模式及其与瘤特征和治疗结果的关联.
- 创建一个全面的转移性瘤微生物群.
主要方法:
- 基于映射和组装的元基因组学,基因组学,转录组学和临床数据的综合分析.
- 检查了4,160个转移性瘤活检.
- 使用纵向瘤采样来追踪微生物的演变.
主要成果:
- 在低氧瘤中确定了器官特异性微生物热带和厌氧细菌的丰富.
- 发现微生物多样性与瘤透中性粒细胞之间的关联.
- 与肺癌中免疫检查点阻断 (ICB) 的耐药性相关联,并确定了在ICB上枯竭的细菌.
结论:
- 转移性瘤微生物组表现出器官特异性和时间动态.
- 微生物组成与宿主免疫反应和治疗耐药性相关.
- 这个全癌症资源为推进抗癌治疗策略提供了洞察力.
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