肺癌及其相关呼吸道疾病的交叉特征研究,基于大规模的外基因组测序人口

科学领域:

• 遗传学 是一个遗传学.
• 呼吸系统医学 呼吸系统医学
• 在瘤学瘤学.

背景情况:

• 全基因组关联研究 (GWAS) 确定与疾病易感性相关的常见变异.
• 大规模的测序数据使得在疾病发病过程中探索罕见的编码变体成为可能.

研究的目的:

• 为了研究九种呼吸道疾病和肺癌之间的遗传相关性.
• 为了识别与肺癌和相关的呼吸道疾病相关的罕见编码变体和类效应.
• 探索从呼吸道疾病到肺癌的潜在因果调解途径.

主要方法:

• 链接不平衡得分回归 (LDSC) 用于遗传相关性估计.
• 在单个变体和基因水平上使用英国生物银行全外体序列 (WES) 数据进行外体全外体关联研究 (EWAS).
• 跨特征元分析 (ASSET) 和in-silico功能分析.
• 因果调解分析,以评估疾病途径.

主要成果:

• 五种呼吸道疾病 (肺,肺炎,喘,慢性肺炎,纤维化) 与肺癌存在遗传相关性.
• 确定了102个显著的独立变异和145个类变异.
• 发现了共享的变异 (例如,在CHRNA5) 和重要的基因 (例如,HSD3B7,SRSF2,TERT).
• 证明了类基因的功能丰富,并确定了从呼吸道疾病到肺癌的调解效应 (6-23%).

结论:

• 肺癌和几种呼吸道疾病之间存在共同的遗传结构.
• 已识别的类变体和基因为共享的病原体提供了洞察力.
• 因果调解分析表明,呼吸道疾病作为肺癌发病率的中间途径.