在Paenibacillus polymyxa DSM 365中进行基因组缩小,用于底盘开发
Giulia Ravagnan1, Janne Lesemann1, Moritz-Fabian Müller2
1Institute of Molecular Microbiology and Biotechnology, University of Münster, Münster, Germany.
Frontiers in bioengineering and biotechnology
|April 12, 2024
概括
我们向您介绍了Paenibacillus polymyxa DSM 365的第一个完整的基因组序列,这是一种用于生物技术的强壮微生物. 开发了基因组减少策略,为增强生物生产创造了可行的底盘变体.
科学领域:
- 微生物生物技术和合成生物学
- 基因组学和基因组工程
背景情况:
- Paenibacillus polymyxa DSM 365是一种代谢多功能微生物,具有生物技术应用的潜力.
- 开发强大的微生物平台对于取代基于化石的工艺至关重要.
- 完整的基因组序列对于将Paenibacillus polymyxa工程化为微生物底盘至关重要.
研究的目的:
- 报告Paenibacillus polymyxa DSM 365的第一个完整的基因组序列.
- 为了改进生物生产,设计Paenibacillus polymyxa的基因组缩小型变种.
- 为了验证工程菌株适合进一步的基因改造.
主要方法:
- 全基因组测序和Paenibacillus polymyxa DSM 365的组装.
- 单一淘汰突变和基因组缩小变体 (GR1,GR2) 的构建.
- 评估工程菌株的生长特征和产量标题.
主要成果:
- 为Paenibacillus polymyxa DSM 365建立了一个封闭的基因组序列 (5,889,536 bp).
- 两种基因组缩小型变异 (GR1和GR2) 已成功创建,基因组大小减少 (3.0%和0.6%).
- 工程变种表现出野生类型的生长和不受影响的2,3-butanediol和外聚糖的生产.
结论:
- 完整的基因组序列为Paenibacillus polymyxa DSM 365作为微生物底盘提供了基础.
- 基因组缩小策略可以产生适合工业生物技术的可行底盘变体.
- 工程菌株被验证用于进一步的基因工程和生物生产优化.
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