对鱼应用的几何形态学的新见解,用于物种识别

科学领域:

• 鱼类学 鱼类学 鱼类学
• 形态测量法 形态测量法 形态测量法
• 生物信息学是一种生物信息学.

背景情况:

• 准确的鱼类物种识别在各种科学和商业环境中至关重要.
• 皮肤尺度分析提供了一种潜在的快速和具有成本效益的鱼类识别方法.
• 几何形态测量为分析尺度形态学提供了有希望的技术,但比较研究是有限的.

研究的目的:

• 为了比较两种几何形态测量方法的有效性,用于使用皮肤尺度识别鱼类物种.
• 评估基于地标和基于轮的方法,对五种不同的远端物种进行评估.
• 通过使用这些形态测量技术,研究鱼识别自动化的潜力.

主要方法:

• 应用基于地标的几何形态测量,使用R包"geomorph".
• 开发了一种新的方法,将地标和半地标结合起来,用于鱼类尺度分析.
• 使用R包"Momocs"使用基于轮的几何形态测量.
• 分析了来自 *Danio rerio*, *Dicentrarchus labrax*, *Mullus surmuletus*, *Sardina pilchardus* 和 *Sparus aurata* 的规模数据集.

主要成果:

• 这两种几何形态测量方法都成功地聚集了五个远距离物种.
• 基于里程碑的方法通常在物种聚类中产生更高的R2值.
• 基于轮的方法比基于地标的方法区分更多的物种对.
• 基于轮的方法显示出自动化潜力,因为它独立于地标放置.

结论:

• 几何形态测量,特别是基于轮的分析,是从天平中识别鱼类物种的可行工具.
• 基于概要的方法显示了未来自动化鱼类识别系统的更高潜力.
• 使用更大的数据集进行进一步的研究可以提高鱼类尺度分析的基于轮的几何形态测量的性能.