长非编码RNA Meg3 在干细胞分化过程中调解印记基因表达
Sabina Farhadova1,2,3, Amani Ghousein1,2, François Charon4
1Institute of Molecular Genetics of Montpellier (IGMM), Centre National de Recherche Scientifique (CNRS), 34090 Montpellier, France.
长非编码RNAMeg3对于抑制母体染色体上的发育基因Dlk1和Rtl1至关重要. 梅格3还影响了三维基因组结构,影响了基因调节.
科学领域:
- 基因组学就是基因组学.
- 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.
- 发展生物学 发展生物学
背景情况:
- Dlk1-Dio3位点被印制,关键的发育基因被沉默在母亲的染色体上.
- 父亲的等位基因表达一个多基斯特龙,包括Meg3长非编码RNA (lncRNA),microRNA和snoRNA.
研究的目的:
- 研究Meg3 lncRNA在Dlk1-Dio3域内印制基因的cis调节中的作用.
- 要确定Meg3 lncRNA是否控制基因抑制并影响染色体结构.
主要方法:
- 产生小鼠胚胎干细胞 (mESCs) 具有降低的多基斯特龙RNA水平和Rian淘汰.
- 通过CRISPR介导的脱甲基化来实现双基Meg3表达.
- 捕获Hi-C以分析拓关联域 (TAD) 组织.
主要成果:
- 在ESC分化过程中,Meg3 lncRNA,但不是Rian,是Dlk1抑制所需的.
- 双性Meg3表达导致Dlk1的抑制和Rtl1表达的丧失.
- 梅格3的表达与DNA低甲基化,CTCF结合,以及形成将梅格3与DLK1.1连接的TAD相关.
结论:
- 梅格3 lncRNA在抑制Dlk1和Rtl1在母亲染色体上起着至关重要的作用.
- 梅格3参与建立调节Dlk1-Dio3域内基因表达的TAD结构.
- 异常MEG3表达可能导致人类印记障碍.
更多相关视频
10:48Differentiation of a Human Neural Stem Cell Line on Three Dimensional Cultures, Analysis of MicroRNA and Putative Target Genes
Published on: April 12, 2015
09:07Prediction and Validation of Gene Regulatory Elements Activated During Retinoic Acid Induced Embryonic Stem Cell Differentiation
Published on: June 21, 2016
相关概念视频
Master Transcription Regulators
Genomic Imprinting and Inheritance
The expression of some genes depends on which parent passed the gene to the offspring, through a phenomenon known as...
Maintenance of the ES Cell State
lncRNA - Long Non-coding RNAs
Somatic to iPS Cell Reprogramming
MicroRNAs
