高通量μPAD与级信号放大通过双酶在米土壤中的arsM
Haorui Cao1,2, Kang Mao1, Jiajia Yang1
1State Key Laboratory of Environmental Geochemistry, Institute of Geochemistry, Chinese Academy of Sciences, Guiyang 550081, China.
Analytical chemistry
|April 13, 2024
概括
一个新的多重CRISPR/Cas12a微流体纸张装置使arsM基因的高通量现场选成为可能,arsM基因是土中素暴露的生物标志物. 这种方法为大规模的环境监测提供了更好的灵敏度和快速分析.
科学领域:
- 环境科学 环境科学
- 生物技术是生物技术.
- 分析化学 分析化学
背景情况:
- arsM基因是大米土壤中暴露风险的关键指标.
- 目前对arsM的现场选方法缺乏在使用点 (POU) 的高通量能力.
研究的目的:
- 开发一种高通量POU方法,用于在米土壤中分析arsM基因.
- 构建一个多重CRISPR/Cas12a微流体基于纸的分析装置 (μPAD),用于敏感和快速的arsM检测.
主要方法:
- 一个多重CRISPR/Cas12a μPAD被设计使用合crRNA增强的Cas12a和HRP修改的探针进行级联放大.
- 优化涉及评估crRNAs,开发合系统以提高灵敏度32倍,并结合HRP修改的ssDNA记者以达到16 fM检测极限 (LOD).
- 开发了32个通道的多重芯片,用于同时进行样本分析,简化了预处理,并实现了高通量POU选.
主要成果:
- 开发的试验表明灵敏度增加了32倍,LOD低至16 fM,结果可见.
- 多重 μPAD 实现了同时对 32 个样本的高通量分析,回收率在 87.70% 和 114.05% 之间.
- 旺山田土壤的现场查显示,arsM的丰度范围为1.05 × 10^6至6.49 × 10^7副本/g,不受其他环境指标的影响.
结论:
- 一种新的基于crRNA的级联放大方法与多重微流体装置相结合,为在米土壤中进行高通量,现场arsM选提供了强大的工具.
- 开发的μPAD显著提高了对暴露生物标志物的大规模环境监测的分析性能.
- 这项技术为快速和灵敏地检测arsM提供了一个有希望的解决方案,解决了当前POU方法的局限性.
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