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Updated: Jun 28, 2025

T and B Cell Receptor Immune Repertoire Analysis using Next-generation Sequencing

T and B Cell Receptor Immune Repertoire Analysis using Next-generation Sequencing

Published on: January 12, 2021

通过将来自多只小鼠的同类细胞样本组合起来,在小型生物样本中加强对比性T细胞受体谱分析

Vanessa Mhanna¹, Pierre Barennes¹, Hélène Vantomme²

¹Sorbonne Université, INSERM, Immunology-Immunopathology-Immunotherapy (i3), 75005 Paris, France; AP-HP, Hôpital Pitié-Salpêtrière, Clinical Investigation Center for Biotherapies (CIC-BTi) and Immunology-Inflammation-Infectiology and Dermatology Department (3iD), Paris, France.

Cell reports methods

|April 13, 2024

概括

组合同源生物样本可以从小样本中增强T细胞受体 (TCR) 谱系测序. 这种方法改善了TCR序列恢复,并使得精确的库存比较成为可能,特别是在有限的细胞子集中.

科学领域:

免疫学免疫学免疫学
基因组学就是基因组学.
生物信息学是一种生物信息学.

背景情况:

从有限的生物样本中鉴定T细胞受体 (TCR) 的特征是具有挑战性的.
低材料输入损害了批量测序质量和TCR序列恢复,以进行可靠的分析.

研究的目的:

为了解决TCR目录分析中小样本大小的局限性.
开发一种方法来提高TCR曲目覆盖率,并实现准确的比较.

主要方法:

实施了一种战略方法,包括将同类的生物样本组合在一起.
应用批量测序技术,对组合和单个样本进行测序.

主要成果:

汇集同类样本显著增强了TCR曲目覆盖范围.
该方法改善了TCR序列的恢复,特别是对于小细胞子集.
能够准确地比较不同大小的T细胞子集的TCR谱.

结论:

样本聚合是一种有效的策略,可以克服TCR谱系研究中材料输入不足的挑战.
这种方法提升了在样本受限研究环境中对T细胞谱的理解.
便于在多种T细胞种群中进行强大的TCR谱系分析和比较.

关键词:

CP: 免疫学免疫学 CP:系统生物学系统生物学 T细胞受体受体的 T 细胞受体.适应性免疫受体谱的测序序列表.多样性的多样性多样性的多样性这里是鼠标鼠标鼠标鼠标鼠标鼠标.这是下一代测序.剧本的覆盖范围剧本的覆盖范围可复制性的可复制性采样采样采样采样统计建模统计建模

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