LAMP测试用于检测Elsinoë necatrix,一个重要的树芽和叶子病原体
Alishia van Heerden1, Nam Q Pham1, Brenda D Wingfield1
1Department of Biochemistry, Genetics and Microbiology, Forestry and Agricultural Biotechnology Institute (FABI), University of Pretoria, Pretoria, South Africa.
Plant disease
|April 15, 2024
概括
一种新的循环介导同热放大 (LAMP) 试验可以快速准确地检测Elsinoë necatrix,这种真菌会导致树的皮和发芽形. 这种方法为商业林业的早期疾病检测提供了一个简单而敏感的工具.
科学领域:
- 植物病理学 植物病理学
- 分子生物学分子生物学
- 林业科学 林业科学
背景情况:
- 由Elsinoë necatrix引起的树和树枝形,是一种威胁全球商业林业的新兴疾病.
- 早期和准确的检测E. necatrix对于疾病管理和预防广泛的损害至关重要.
研究的目的:
- 开发一种快速,灵敏和特定的循环介导同热放大 (LAMP) 试验,用于早期检测埃尔西诺埃病菌.
- 为了验证测试对各种真菌分离物和受感染的植物材料的稳定性和特异性.
主要方法:
- 开发一种针对E. necatrix的二次代谢物基因集群中的独特区域的LAMP测定方法.
- 使用15个E. necatrix.菌株验证试验的性能.
- 对23种相关的Elsinoë物种和三种在Eucalyptus上发现的常见真菌污染物的特异性测试.
- 使用不同度的E. necatrix DNA进行敏感性测试.
- 使用简单的DNA提取方法对受感染的树叶进行测试.
主要成果:
- 开发的LAMP试验显示出高特异性,只能识别E. necatrix分离物.
- 该试验表现出高灵敏度,检测到只有0.01 ng的纯E. necatrix DNA (约. 400个目标副本).
- 在受感染的树叶中,E. necatrix被成功检测出来,使用了与简单的DNA提取协议相结合的测试方法.
结论:
- 开发的LAMP检测方法提供了一种简单,快速和高度敏感的方法,用于早期检测埃尔西诺埃菌根.
- 这种测试是树种植园疾病监测和管理的宝贵工具,有助于保护全球林业产业.
