在大脑器官中生成单细胞和单核转录组的生成和下游分析
Miriam Wandres1, Denise Aigner1, Nicolai Kastelic2
1Berlin Institute for Medical Systems Biology (BIMSB), Max Delbrück Center for Molecular Medicine (MDC); Institut für Biologie, Humboldt-Universität zu Berlin.
Journal of visualized experiments : JoVE
|April 15, 2024
概括
单细胞和单核转录组为研究大脑器官提供了强大的工具. 本协议详细介绍了分离细胞或细胞核的方法,以分析基因表达和了解大脑发育.
科学领域:
- 神经科学是一个神经科学.
- 基因组学就是基因组学.
- 发展生物学 发展生物学
背景情况:
- 单细胞转录组学使细胞多样性分析成为可能.
- 单核测序克服了难以隔离细胞的局限性.
- 大脑器官是研究人类大脑发育的关键模型.
研究的目的:
- 为大脑器官中单细胞和单核转录学提供一个全面的协议.
- 为了使转录组分析在脑器官研究中得到普遍应用.
- 为了促进对大脑发育的详细调查.
主要方法:
- 器官分裂和单细胞/细胞核隔离.
- 图书馆的准备和排序. 图书馆的准备和排序.
- 对基因表达数据的生物信息分析.
主要成果:
- 来自大脑器官的高质量的转录数据集.
- 识别不同的神经元和非神经元细胞类型.
- 基因表达特征和细胞谱系轨迹的表征.
结论:
- 单细胞和单核转录组学对于脑器官研究至关重要.
- 该协议增强了对大脑发育中的细胞和分子机制的研究.
- 这些方法使大脑器官模型的全面分析成为可能.


