一个基于HPV相关的头角状细胞癌中氨基酸代谢模式的预后模型
Fengyang Jing1, Lijing Zhu1, Jiaying Bai2
1Department of Oral Pathology, Peking University School and Hospital of Stomatology, National Center of Stomatology, National Clinical Research Center for Oral Diseases, National Engineering Laboratory for Digital and Material Technology of Stomatology, Beijing Key Laboratory of Digital Stomatology, Research Center of Engineering and Technology for Computerized Dentistry Ministry of Health, NMPA Key Laboratory for Dental Materials, Beijing 100081, China; Research Unit of Precision Pathologic Diagnosis in Tumors of the Oral and Maxillofacial Regions, Chinese Academy of Medical Sciences (2019RU034), Beijing 100081, China.
脑状细胞癌 (HNSCC) 的明确氨基酸代谢模式在人类乳头瘤病毒 (HPV) 阳性和阴性患者之间有所不同. 使用关键基因的新预后模型显示,它有望预测HNSCC的结果.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 代谢学 代谢学 代谢学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 头部和部状细胞癌 (HNSCC) 呈现出基于人类乳头瘤病毒 (HPV) 状态的独特分子概况.
- 氨基酸代谢在癌症的发展和进展中起着至关重要的作用.
- 了解这些代谢差异可以导致更好的预后工具.
研究的目的:
- 为了比较HPV阳性和HPV阴性HNSCC之间的氨基酸代谢基因表达模式.
- 确定开发HNSCC.预后模型的关键基因.
- 验证开发模型的预后能力和生物相关性.
主要方法:
- 对氨基酸代谢基因的癌症基因组图谱 (TCGA) 数据集的分析.
- 基于HPV状态的差异表达基因的识别.
- 使用LASSO回归和免疫组织化学验证的预后模型的开发.
- 功能丰富和免疫细胞透分析 (CIBERSORTx).
主要成果:
- 确定了1157个与氨基酸代谢和HNSCC中的HPV状态相关的关键基因.
- 一个结合IQCN,SLC22A1,SYT12和TLX3等基因的预后模型显示出显著的预测能力.
- 该模型与免疫细胞透相关,与传统分期相比,它显示出更好的预后能力.
- 功能性丰富揭示了在发育,新陈代谢和受体/酶通路中的作用.
结论:
- 在HPV阳性和HPV阴性HNSCC之间存在氨基酸代谢的显著差异.
- 开发的预后模型有效预测HNSCC的结果.
- 这个模型可以帮助指导HNSCC患者的治疗策略.
