克莱布西拉肺炎序列类型147:一种高风险的克隆,与携带耐药性和毒性元素的等离子体日益相关

科学领域:

• 微生物学 微生物学
• 遗传学 是一个遗传学.
• 传染性疾病 传染性疾病

背景情况:

• 在Klebsiella pneumoniae中出现混合耐药性/病毒性等离子体,特别是在序列类型 (ST) 147中,构成重大威胁.
• 这些等离子体结合了高病毒性和结合性耐药性等离子体的特征,使感染的治疗和控制复杂化.
• 这些杂交等离子体在非住院Klebsiella pneumoniae分离物中的流行程度需要进行彻底的调查.

研究的目的:

• 来自英国参考实验室的Klebsiella pneumoniae分离物中确定毒性/耐药性等离子体的发生.
• 专门调查ST147分离物中这些等离子体的存在和特征.
• 为了比较已识别的杂交等离子体的遗传序列.

主要方法:

• 使用PCR对1278个Klebsiella pneumoniae分离物 (2022-2023) 进行病毒性等离子体标志物 (rmpA/rmpA2) 的查.
• 变量数串重复分析用于隔离类型.
• 29个ST147代表的长读纳米孔测序,用于完整的基因组和等离子体组装.

主要成果:

• 在110个分离物中检测到rmpA/rmpA2;47个ST147分离物中,有22个呈阳性.
• 纳米孔测序显示,ST147分离物中没有毒性质体,没有NDM毒性质体,或有blaNDM-5或blaNDM-1的质体.
• 混合等离子体属于IncFIB (pNDM-Mar) /IncHI1B (pNDM-MAR) 复制体类型,携带NDM的等离子体表现出广泛的抗性基因.

结论:

• 在ST147 Klebsiella pneumoniae分离物中,很大一部分携带IncFIB (pNDM-Mar) /IncHI1B (pNDM-MAR) 混合抗毒性等离子体.
• 这些混合等离子体赋予了耐药性和毒性,增加了医疗机构患者的风险.
• 对ST147携带这些等离子体的倾向的认识对于感染控制和患者管理至关重要.