通过支气管镜获得的冷细胞学颗粒的实用性,用于下一代测序

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 基因组学就是基因组学.
• 肺部病理学 肺部病理学

背景情况:

• 下一代测序 (NGS) 对于个性化肺癌治疗至关重要.
• 对于NGS,通常需要足够的组织样本,但样本的充分性可能是一个挑战.
• 对NGS进行替代样本类型的研究对于改善诊断产量至关重要.

研究的目的:

• 评估冷细胞学颗粒的诊断产量,用于肺癌患者的NGS分析.
• 为了比较冷细胞学颗粒与冷组织样本的DNA和RNA产量.
• 评估使用冷细胞学颗粒进行NGS分析的成功率.

主要方法:

• 回顾性招募肺癌患者进行支气管镜检查.
• 收集和冷保存细胞以形成冷细胞学颗粒.
• 从颗粒和组织中提取DNA和RNA,然后使用Oncomine试验进行NGS分析.
• 细胞学颗粒和组织之间的DNA/RNA产量和NGS成功率的比较,以及不同的支气管镜法.

主要成果:

• 冷细胞学颗粒产生了与冷组织相比的DNA和RNA量.
• 胸膜超声导向的跨胸膜针吸收 (EBUS-TBNA) 细胞学颗粒提供了明显更多的DNA比跨胸膜活检 (TBBx) 方法.
• 对于冷细胞学颗粒和冷组织样本,NGS的成功率相似.

结论:

• 冷细胞学颗粒显示,在肺癌中对NGS的冷组织具有相当的诊断价值.
• 支气管细胞学,当加工成颗粒时,可以用于NGS,扩大其诊断效用.
• EBUS-TBNA是一种特别有效的方法,可以从细胞学样本中获得足够的细胞材料进行基因组分析.