检测T细胞克隆扩张和量化克隆存活,使用免疫谱的深度分析
Anastasia V Pavlova1,2, Ivan V Zvyagin1,2,3, Mikhail Shugay1,2
1Institute of Translational Medicine, Center for Precision Genome Editing and Genetic Technologies for Biomedicine, Pirogov Russian National Research Medical University, Moscow, Russia.
Frontiers in immunology
|April 18, 2024
概括
这项研究引入了一种新的生物信息学方法来追踪T细胞受体动态. 这种方法量化了T细胞谱的变化,提供了对移植和疫苗接种后免疫反应的见解.
科学领域:
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 生物信息学是一种生物信息学.
- 计算生物学 计算生物学
背景情况:
- T细胞的谱系是动态的,受到外部和内部因素的影响.
- 在遇到病原体或接收共刺激信号时,T细胞克隆会扩大.
- 通过V(D) J重排序的T细胞受体 (TCR) 测序,可以追踪T细胞克隆.
研究的目的:
- 开发和验证一种生物信息学方法,用TCR测序数据量化T细胞谱系动态.
- 证明这种方法在各种免疫学环境中的实用性.
主要方法:
- 开发一种新的生物信息管道,用于分析TCR测序数据.
- 该方法应用于来自健康捐赠者,造血干细胞移植 (HSCT) 患者和接种疫苗的个体的数据集.
主要成果:
- 在健康个体中量化T细胞谱的稳定性.
- 测量供体淋巴细胞输液 (DLI) 对T细胞动态的影响.
- 在HSCT患者中追踪T细胞子集命运和疫苗接种后病原体特异性克隆的扩张.
结论:
- 开发的生物信息学方法准确量化T细胞谱系动态.
- 这个工具提供了宝贵的见解,在HSCT后免疫复原,癌症治疗反应和疫苗诱导的免疫力.


