对与免疫相关的微生物组和头部和部状细胞癌的预后模型的多组分析
Yingqiao Liu1, Haitao Lin1, Weijun Zhong1
1Department of Oral and Maxillofacial Surgery, Nanfang Hospital, Southern Medical University, Guangzhou, 510515, China.
Clinical oral investigations
|April 20, 2024
概括
这项研究揭示了与头癌 (HNSCC) 免疫亚型和预后相关的独特微生物特征. 免疫相关微生物组 (IRM) 模型比TNM分期更好地预测存活率,帮助治疗决策.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 微生物学 微生物学
- 免疫学 免疫学 免疫学
背景情况:
- 头部和部状细胞癌 (HNSCC) 呈现出多种不同的免疫表型.
- 了解瘤免疫和微生物组之间的相互作用对于HNSCC预后至关重要.
研究的目的:
- 探索HNSCC免疫表型的转录和微生物特征.
- 开发一个综合免疫和微生物数据的预后模型.
主要方法:
- 使用TCGA数据进行HNSCC免疫细胞分析 (CIBERSORT,DESeq2).
- 从TCMA数据库 (LEfSe算法) 中分析了微生物概况.
- 使用随机森林和深度神经网络 (DNN) 开发了一个预测模型.
主要成果:
- 确定了三种HNSCC免疫亚型,其中ICI-2显示出最差的预后.
- 免疫相关微生物组 (IRM) 模型在生存预测中表现优于TNM分期.
- 在IRM模型中,低风险患者对西斯和索拉费尼布的敏感性增加.
结论:
- 在HNSCC.免疫细胞透 (ICI) 景观的全面探索.
- 在ICI模式,内微生物组和预后之间建立了相关性.
- 该IRM预后模型有助于早期预测和HNSCC治疗的临床决策.


