用外体序列和临床数据进行基因组首次评估,在一个大型医疗保健系统中发现了被诊断不足的遗传疾病
Iain S Forrest1, Áine Duffy2, Joshua K Park1
1The Charles Bronfman Institute for Personalized Medicine, Icahn School of Medicine at Mount Sinai, New York, NY 10029, USA; Medical Scientist Training Program, Icahn School of Medicine at Mount Sinai, New York, NY 10029, USA; Department of Genetics and Genomic Sciences, Icahn School of Medicine at Mount Sinai, New York, NY 10029, USA.
全人口基因组查识别了许多具有疾病风险变异的个体. 这些患者中有很大一部分缺乏临床诊断,这显示出新的诊断和改善患者护理的潜力.
科学领域:
- 基因组学就是基因组学.
- 医学遗传学 医学遗传学
- 人口健康 人口健康
背景情况:
- 基于人口的基因组查提供了一种积极的方法来识别对疾病有遗传倾向的个体.
- 电子健康记录 (EHR) 对于将遗传发现与临床诊断联系起来至关重要.
研究的目的:
- 评估基因组第一方法在大量人口队列中识别疾病风险变异的实用性.
- 通过将遗传发现与EHR中现有的临床诊断进行比较,评估基因组查的诊断产量.
主要方法:
- 对29,039名参与者进行了基因组首次评估,使用外体序列和链接的EHR.
- 在九种疾病中确定了致病性/可能致病性或预测功能丧失 (P/LP/LoF) 变体.
- 针对携带已识别变异的个体,研究了EHR中的临床诊断.
主要成果:
- 614人被发现有303种P/LP/LoF变异,其中76%的人在他们的EHR中缺乏相应的临床诊断.
- 进一步的调查显示,15%的临床未诊断个体有症状,未经治疗的疾病,包括家族性高胆固醇血症和乳腺癌.
- 在高度透基因的变异中,疾病产量更高,这表明临床效用更大.
结论:
- 基于人口的基因组查可以发现大量未被诊断的遗传疾病的个体.
- 基于遗传发现的有针对性的表型定型可以导致以前未被诊断的患者的新诊断.
- 鉴定的遗传变异的流行率往往超过当前的临床诊断,突出了主动基因组查的潜力.
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