与全基因组测序相比,eazyplex® SuperBug AmpC测定可快速检测等离子体介导的AmpC生成物
Vladimira Hinić1, Helena M B Seth-Smith2, Sabrina Stammler3
1Division of Clinical Bacteriology and Mycology, University Hospital Basel, Basel, Switzerland; Institute of Medical Microbiology, University of Zurich, Zurich, Switzerland.
Journal of microbiological methods
|April 20, 2024
概括
该Eazyplex SuperBug AmpC测试准确地检测了肠杆菌中常见的等离子体介导的AmpC (pAmpC) 基因. 这种分子测试可以区分pAmpC和大肠杆菌中的染色体编码的AmpC,帮助快速诊断.
科学领域:
- 临床微生物学 临床微生物学
- 分子诊断学 分子诊断
- 抗微生物耐药性 抗微生物耐药性
背景情况:
- 等离子体介导的AmpCβ-乳酸酶 (pAmpC) 在抗菌素耐药性方面至关重要.
- 目前的检测方法依赖于表型测试,这可能耗时.
- 需要进行快速分子分析,以便及时识别产生pAmpC的肠道细菌.
研究的目的:
- 为了评估Eazyplex SuperBug AmpC测试的诊断性能.
- 评估其在临床隔离物中检测常见的pAmpC类型 (CMY-2,DHA,ACC,MOX) 的能力.
- 将分子检测与全基因组测序 (WGS) 进行比较,并区分质粒介导与染色体AmpC.
主要方法:
- 评估Eazyplex SuperBug AmpC测定在64个临床肠杆菌分离物中进行的证实AMpC生产的测定.
- 隔离物以全基因组测序 (WGS) 为特征,以确认.
- 专注于没有染色体诱导AmpC的隔离物,以具体评估pAmpC检测.
主要成果:
- 该试验正确识别了CMY-2 (16/16) 和DHA (19/19) pAmpC类型.
- 由于可用隔离物,ACC和MOX的检测受到限制.
- 在大肠杆菌中,检测检测到8/36个隔离物中的pAmpC基因;剩下的28个具有促进子突变,导致染色体AmpC过度表达.
- 在Eazyplex测定和WGS结果之间观察到100%的一致性.
结论:
- 该Eazyplex SuperBug AmpC测试提供了快速和可靠的检测pAmpC编码基因在肠杆菌.
- 它有效地区分了E. coli中的等离子体介导和染色体编码的AmpC.
- 这种分子检测是常规微生物实验室的宝贵工具.
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