用于定义和操纵干扰素诱导的Ubl蛋白酶USP1818的化学工具

科学领域:

• 生物化学和分子生物学
• 蛋白酶活动概况分析
• 化学生物学是化学生物学.

背景情况:

• 乌比基特异蛋白酶18 (USP18) 是干扰素诱导ISG15结合路径中的一个关键酶.
• USP18在包括癌症在内的各种生物过程和疾病中的作用,需要精确的活动评估方法.
• 现有的方法难以选择性地区分USP18活动与处理ISG15.5的其他二维基因酶 (DUB).

研究的目的:

• 设计和合成基于活动的新型探测器 (ABP),用于选择性检测USP18活动.
• 将这些探针用于化学蛋白质查,以识别USP18抑制剂.
• 在疾病背景下描述USP18活动,例如肺癌.

主要方法:

• 将非自然氨基酸纳入基于ISG15的探针以增强USP18的选择性.
• 开发一种化学蛋白质查平台,将USP18特定的ABP与基于ubiquitin的DUB ABP结合起来.
• 应用该平台来识别和评估针对USP18和其他DUB的抑制剂.

主要成果:

• 成功合成了能够区分USP18活动与其他ISG15交叉反应DUB的USP18选择性ABP.
• 通过化学蛋白质查证明了USP18 ABP在识别潜在的USP18抑制剂方面的实用性.
• 展示了USP18 ABPs的应用,用于在肺癌细胞系中分析USP18活性差异.

结论:

• 开发的USP18 ABP为USP18.18的选择性基于活动的分析提供了一个强大的工具.
• 这一策略有助于发现USP18抑制剂,并评估其在疾病环境中的活性.
• 能够更深入地了解 (de) ISGylation 相关的生物过程和 USP18 在疾病中的作用.