在小鼠巨细胞中指导Il6转录的假定增强器区域的识别和表征
Norisuke Kano1, Takeo Miki1, Yurina Uehara1
1Laboratory of Molecular Immunobiology, Division of Biological Science, Graduate School of Science and Technology, Nara Institute of Science and Technology (NAIST), Nara 630-0192, Japan.
International immunology
|April 22, 2024
概括
研究人员确定了两个增强器区域,E1和E2,对于巨细胞中强大的Interleukin-6 (IL-6) mRNA表达至关重要. 这些区域对于免疫反应和炎症性疾病至关重要.
科学领域:
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 分子生物学分子生物学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 洲际蛋白-6 (IL-6) 是免疫反应中的一个关键细胞因子.
- 失调的IL-6表达与高炎症和慢性疾病有关.
研究的目的:
- 确定控制巨细胞Il6mRNA表达的增强子区域.
- 研究Il6基因表达的调节机制.
主要方法:
- 在LPS激活的小鼠巨细胞中进行全基因组ChIP-seq和ATAC-seq分析.
- 鉴定基因组修饰,开放色素和转录因子结合位.
- 使用ncRNA抑制,基因删除和CRISPR/dCas9激活的功能验证.
主要成果:
- 两种不同的增强剂群 (E1和E2) 从Il6基因中确定在-144到-163kb.
- E1和E2区域显示活跃的基因素标记,开放的染色质,以及PU.1,NF-κB,C/EBPβ和JunB.的结合部位.
- 在LPS刺激时,从E1/E2的ncRNAs的升级;抑制取消了Il6表达.
- 删除E1或E2损害了Il6表达; p300招募增强了Il6表达.
结论:
- 在巨细胞中,E1和E2区域作为Il6基因表达的关键增强剂.
- 这些增强剂在炎症反应期间调节IL-6产生的过程中起着重要作用.
