血统特定的转录因子波将神经母细胞瘤从自我更新重编程到分化
Deblina Banerjee1, Sukriti Bagchi2, Zhihui Liu2
1Cell & Molecular Biology Section, Pediatric Oncology Branch, Center for Cancer Research, National Cancer Institute, Bethesda, MD, USA. banerjee.deblina@gmail.com.
超强增强剂调节神经母细胞瘤 (NB) 的自我更新和分化. 全跨网红酸 (ATRA) 治疗揭示了SOX11和SOX4转录因子对NB发育和分化至关重要.
科学领域:
- * 分子生物学 * 分子生物学
- * 发育生物学 发育生物学
- * 癌症研究 癌症研究
背景情况:
- *神经母细胞瘤 (NB) 是由于对交上腺原体的终端分化失败而导致的.
- *超级增强剂 (SE) 在发育过程中对转录因子 (TF) 的时间调节至关重要.
- * 在NB中理解SE驱动的TF是确定治疗点的关键.
研究的目的:
- * 确定监管TF的SE,这些SE是NB自我更新和差异化的驱动因素.
- * 研究SEs和相关TFs在全转网红酸 (ATRA) 诱导的NB分化过程中的作用.
- *为了验证已识别的TF在NB增长和差异化中的功能意义.
主要方法:
- *用ATRA治疗的NB细胞的H3K27acChIP-seq和RNA-seq时间分析.
- *CRISPR-Cas9和siRNA用于基因沉默.
- *dCAS9-KRAB可以对特定的SE进行沉默.
- * 在体外和体内活体功能测定.
主要成果:
- *ATRA治疗诱导了协调的SE活动波.
- * 减少SE与干细胞TF如MYCN,GATA3和SOX11有关,证实了SOX11的依赖性.
- *抑制SOX11 SE减少了SOX11 mRNA,并抑制了NB细胞的生长.
- * TFs (GATA2,SOX4) 的连续波被激活,调节神经发育.
- *静止SOX4 SE减少了SOX4表达和减弱了分化基因.
结论:
- * 已识别的SE驱动瘤性TF,负责NB自我更新.
- *特征TFs (SOX11,SOX4) 对于实施NB差异化计划至关重要.
- * 证明了在NB中针对SE进行治疗干预的潜力.
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