OmicNavigator:一个开源软件,用于探索,可视化和对OMIC研究的存档

科学领域:

• 生物信息学是一种生物信息学.
• 计算生物学 计算生物学
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• 高通量欧米克实验产生了难以探索,存档和共享的庞大数据集.
• 奥米克数据的数量和复杂性日益增加,加上各种分析方法和可视化偏好,带来了重大挑战.
• 现有的软件解决方案往往缺乏灵活性,无法容纳广泛的分析方法和用户特定的可视化.

研究的目的:

• 介绍OmicNavigator,这是一个开源的R包,用于管理omics数据.
• 为提供一个用于存档,可视化和交互探索omics研究结果的工具.
• 为了使生物信息学家能够创建可共享的Web应用程序,用于OMIC数据分析.

主要方法:

• 开发了一个名为OmicNavigator的R包.
• 实现用于创建交互式Web应用程序的功能.
• 集成自定义可视化,分析结果和衍生分析工具.

主要成果:

• OmicNavigator允许生物信息学家构建提供自定义可视化和分析结果的Web应用程序.
• 这些应用程序可以包括从分析中得出的交互表和图形.
• 由OmicNavigator生成的研究可以在R会话中探索或在服务器上托管以获得更广泛的访问.

结论:

• OmicNavigator提供了一个灵活的解决方案,用于存档和探索omics数据.
• 该包支持创建交互和可共享的OMIC数据探索工具.
• OmicNavigator作为开源软件可供研究社区使用.