开发一种反转录循环介导的异热放大试验,使用新的定量pH生物传感器读取方法来检测SARS-CoV-2
Dian Ekayanti Astari1,2, Muhammad Nasrum Massi1,3, Rina Masadah1,4
1Department of Biomedicine, Graduate School Hasanuddin University, Makassar, Indonesia.
概括
这项研究开发了一种用于检测SARS-CoV-2的定量pH生物传感器,使用反转录循环介导的同热放大 (RT-LAMP). 这种客观的方法显示了快速和简单的COVID-19诊断的潜力.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 生物技术是生物技术.
- 传染病诊断 传染病诊断 传染病诊断
背景情况:
- 反转录循环介导的同热放大 (RT-LAMP) 提供了比RT-PCR更快的SARS-CoV-2检测.
- 目前的RT-LAMP测试通常依赖于主观的视觉解释.
- 为了可靠的RT-LAMP诊断,需要客观的量化.
研究的目的:
- 开发和验证用于检测SARS-CoV-2的具有定量pH测量的RT-LAMP试验.
- 将pH生物传感器读数的性能与定性方法进行比较.
- 评估这种定量方法对客观分子诊断的潜力.
主要方法:
- 开发了一种新的便携式pH生物传感器,用于定量RT-LAMP.
- 使用57个临床COVID-19样本验证了测试.
- 将pH传感器结果与色度解释和凝电泳进行比较.
- 与RT-PCRCt值相关联的生物传感器pH读数.
主要成果:
- 在RT-LAMP试验中,检测极限 (LoD) 为10^3副本/μL.
- pH传感器显示高特异性 (87.5%) 和概率比 (6.72).
- 在COVID-19阳性 (6.15 ± 0.27) 和阴性 (6.72 ± 0.22) 样本之间观察到显著的pH差异 (p < 0.0001).
- 在生物传感器pH值和RT-PCRCt值之间发现了强烈的相关性 (r = 0.78,p < 0.0001).
结论:
- 具有定量pH传感器读数的RT-LAMP为主观解释提供了一个客观的替代方案.
- 这种方法与RT-PCR有很强的相关性,表明其诊断潜力.
- 开发的测定方法适用于快速,简单和客观的SARS-CoV-2检测.
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