综合生物信息学分析和实验动物模型确定了一个强大的生物标志物及其与肺动脉高血压中免疫微环境的相关性
Mukamengjiang Juaiti1, Yilu Feng1, Yiyang Tang1
1Department of Cardiology, Xiangya Hospital, Central South University, Changsha, Hunan, 410008, P.R. China.
Heliyon
|April 25, 2024
概括
使用生物信息学确定了肺动脉高血压 (PAH) 生物标志物. 该研究发现BPIFA1是关键的诊断标志物,与PAH中的免疫细胞变化有关.
科学领域:
- 生物医学研究的研究.
- 生物信息学是一种生物信息学.
- 免疫学 免疫学 免疫学
背景情况:
- 肺动脉高血压 (PAH) 构成一个重要的全球健康风险.
- 确定PAH的诊断生物标志物对于患者的治疗结果至关重要.
- 了解免疫微环境在PAH中的作用是必不可少的.
研究的目的:
- 为了确定肺动脉高血压 (PAH) 的诊断生物标志物.
- 调查已识别的生物标志物与PAH中的免疫微环境之间的关联.
- 为了利用生物信息学对PAH病原体产生新的见解.
主要方法:
- 微阵列数据集上的差异基因表达分析.
- 机器学习算法 (SVM,LASSO,WGCNA) 用于识别枢纽基因.
- 在外部数据集和单克罗他林诱导的老鼠模型中进行验证;使用MCP-counter,ssGSEA和CIBERSORT进行免疫细胞分析.
主要成果:
- 确定了7个枢纽基因,其中BPIFA1是最稳定和最有效的生物标志物.
- 功能丰富分析揭示了PAH,新陈代谢和免疫系统之间的联系.
- BPIFA1的表达与各种免疫细胞类型相关,包括M1和M2巨细胞.
结论:
- BPIFA1是肺动脉高血压 (PAH) 的潜在诊断生物标志物.
- BPIFA1影响PAH免疫微环境,可能通过调节M1和M2巨细胞.
- 这一发现为PAH管理提供了新的治疗目标.
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