转录组分析确定了共享的诊断生物标志物和动脉样硬化和腹腔大动脉动脉瘤之间的免疫关系,基于脂肪酸代谢基因组

科学领域:

• 心血管研究研究心血管研究
• 代谢学 代谢学 代谢学
• 遗传学 遗传学 是一个

背景情况:

• 脂质代谢障碍与动脉硬化 (AS) 和腹腔大动脉动脉瘤 (AAA) 的风险增加有关.
• 连接脂质代谢,AS和AAA的精确分子机制仍然不完全理解.
• 识别共享的途径和基因对于理解疾病的发病过程至关重要.

研究的目的:

• 研究AS和AAA之间共享的脂肪酸代谢途径.
• 确定与这两种疾病相关的潜在脂肪酸代谢相关基因 (FRG).
• 探索AS和AAA中确定的基因的诊断潜力.

主要方法:

• 用于AS和AAA的基因表达全集 (GEO) 数据集.
• 通过使用limma包,确定了两种疾病共同的差异表达FRG (DFRG).
• 采用LASSO回归,随机森林和名录结构来进行特征基因选择.
• 在外部数据集和临床样本中验证了关键基因.
• 使用ssGSEA评估了免疫细胞透模式.

主要成果:

• 与对照组相比,AS和AAA患者的脂肪酸代谢得分下降.
• 确定了40个重叠的DFRG,突出了脂质和氨基酸代谢的作用.
• 确定了PCBD1,ACADL,MGLL,BCKDHB和IDH3G作为关键的签名基因.
• 这些特征基因在外部数据集和临床样本中得到了验证.
• 中性粒细胞,NK CD56dim细胞和Tem细胞与AS和AAA发育有关,可能与特征基因有联系.

结论:

• 脂肪酸代谢途径与AS和AAA的病变发生有显著的关联.
• 已识别的标志性基因 (PCBD1,ACADL,MGLL,BCKDHB,IDH3G) 是AS和AAA的诊断生物标志物.
• 需要进一步研究脂肪酸代谢与AS和AAA免疫透之间的相互作用.