对比转录组学分析揭示了巴贝尔 (Squaliobarbus curriculus) 对草复原病毒感染的独特免疫反应

科学领域:

• 水生免疫学 水生免疫学
• 鱼类病毒学 鱼类病毒学
• 进行比较的基因组学.

背景情况:

• 草重生病毒 (GCRV) 对水产养殖构成重大威胁,特别影响Leuciscinae亚科中的物种.
• 巴贝尔 (Squaliobarbus curriculus) 与草 (Ctenopharyngodon idella) 相比,对GCRV表现出不同的耐药性.
• 对于疾病管理和选择性繁殖来说,了解巴贝尔巴中GCRV耐药性的分子机制至关重要.

研究的目的:

• 在II型GCRV感染后,研究巴贝尔丘布的抗GCRV免疫机制.
• 为了确定关键的免疫相关途径和与GCRV耐药性相关的差异表达基因 (DEGs).
• 为了解GCRV耐药性提供理论基础,并为涉及鱼和草的繁殖计划提供理论基础.

主要方法:

• 用II型GCRV感染巴贝尔丘布的感染.
• 通过RNA测序 (RNA-seq) 和实时聚合酶连锁反应 (qRT-PCR) 分析肝脏,脏,头脏和干脏组织.
• 基因本体学 (GO) 和基因和基因组的京都百科全书 (KEGG) 路径丰富分析.

主要成果:

• 在所有四种组织中都发现了大量的DEG,其中干脏的数量最多 (2374).
• 免疫反应,模式识别受体 (PRR) 和细胞因子相关途径在GCRV感染的组织中显著丰富.
• 自,亡和补充/凝血级联通路也与免疫反应有关,特别是在像脏这样的特定器官.

结论:

• 鉴定出PRR,细胞因子相关的,补充和凝血级联,细胞灭绝和自途径是赋予巴贝尔小孩GCRV耐药性的潜在关键因素.
• 这项研究提供了全面的转录基因数据,并对巴贝尔的GCRV耐药性的分子基础进行了洞察.
• 这些发现支持开发用于控制GCRV疾病的策略,并培育耐药鱼株.