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Updated: May 1, 2026
07:33
Nanopore DNA Sequencing for Metagenomic Soil Analysis
Published on: December 14, 2017
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血流感染的分子快速诊断测试:使用病原体特异性原始体进行纳米孔向测序
Dongsheng Han1, Fei Yu1, Dan Zhang1
1Department of Laboratory Medicine, the First Affiliated Hospital, Zhejiang University School of Medicine, Hangzhou, Zhejiang 310003, China; Zhejiang Key Laboratory of Clinical In Vitro Diagnostic Techniques, Hangzhou, Zhejiang 310003, China; Institute of Laboratory Medicine, Zhejiang University, Hangzhou, Zhejiang 310003, China.
The Journal of infection
|April 26, 2024
概括
一种新的纳米孔向测序 (NTS) 试验能够快速准确地检测出血流感染 (BSI) 和抗生素耐药性基因. 这种高效的方法为重症患者的早期诊断提供了一个有希望的替代方案.
科学领域:
- 临床微生物学 临床微生物学
- 传染性疾病 传染性疾病
- 基因组医学是一种基因组医学.
背景情况:
- 纳米孔测序为快速诊断提供实时分析.
- 目前用于血液感染 (BSI) 的方法缺乏有效的测定.
- 需要更快,更准确的BSI诊断工具.
研究的目的:
- 评估一种新的纳米孔向测序 (NTS) 试验的性能.
- 为了识别病原体和预测BSI中的抗生素耐药性.
- 评估NTS作为血液感染的诊断工具.
主要方法:
- 对一种新型纳米孔向测序 (NTS) 试验的前性评估.
- 分析了从2021年12月到2023年4月收集的387个血液样本.
- 将NTS与元基因组下一代测序 (mNGS) 和传统血液培养 (BC) 进行比较.
主要成果:
- NTS阳性率 (69.5%) 接近mNGS (74.7%) 并明显超过BC (33.9%).
- 对于BSI检测,NTS表现出高灵敏度 (84.0%) 和特异性 (90.1%).
- NTS确定了诸如K. pneumoniae,P. aeruginosa,E. coli和E. faecium等常见的病原体,与mNGS有90.2%的一致性.
- 通过NTS检测的基因型耐药性与80.6%的病例的表型耐药性相关.
- 对于95%的样本,NTS测试和分析大约在7小时内完成.
结论:
- NTS是一种快速,灵敏和高效的检测BSI的方法.
- NTS准确地识别病原体,并预测抗生素耐药性的基因.
- 在重症患者中,NTS显示出作为早期感染识别的首选诊断工具的潜力.
