爱尔兰Clostridioides difficile分离物的基因型和表型抗菌耐药性,2022年

科学领域:

• 微生物学 微生物学
• 遗传学 是一个遗传学.
• 传染性疾病 传染性疾病

背景情况:

• 困难菌感染 (CDI) 通常发生在抗生素治疗后,导致可变的胃肠道疾病.
• 困难菌中的抗菌素耐药性 (AMR) 带来了治疗挑战,需要有效的监测.
• 在C. difficile中,遗传标记和表型AMR之间的关系尚未完全理解.

研究的目的:

• 为了评估基因型决定因素和C. difficile分离体中的表型抗菌素耐药性之间的相关性.
• 为了确定基因标记在预测C. difficileAMR中的准确性.
• 评估基因型AMR数据对临床治疗和公共卫生监测的有用性.

主要方法:

• 99个C. difficile分离体的表型抗菌耐药性被用Sensititre板和E测试对八种抗生素进行了评估.
• 进行了基因组查,以确定与抗菌素耐药性相关的遗传标记.
• 统计分析包括计算准确度,灵敏度,特异性和预测值.

主要成果:

• 观察到高耐药率 (>50%) 的塞福西丁和克林达米辛;中等率 (10-50%) 的莫西弗洛克萨辛和四环素;低率 (<10%) 的伊米佩内姆,美트로尼达,万科米辛,和利芬皮辛.
• 在莫西弗洛克萨辛 (准确率98%),克林达米辛 (准确率86%) 和四环素 (准确率78%) 之间发现了基因型和表型AMR的强烈相关性.
• 对于剩余的五种抗生素,无法确定准确的相关性估计.

结论:

• 基因型指标可以可靠地预测C. difficile的表型对莫克西弗洛克萨辛,四环素和克林达米辛的耐药性.
• 这些遗传标记物有可能为公共卫生策略提供信息,并优化患者治疗.
• 需要进一步的研究和模型开发,以准确预测C. difficile中的其他抗生素的AMR.