全转录组RNA测序揭示了CeRNA调控网络在老鼠的长期空间复合应激下
YiShu Yin1, JunLian Liu2, Chong Xu3
1School of Medicine and Health, Harbin Institute of Technology, Harbin 150001, PR China; School of Chemistry and Chemical Engineering, Harbin Institute of Technology, Harbin 150001, PR China; National and Local Joint Engineering Laboratory for Synthesis, Transformation and Separation of Extreme Environmental Nutrients, Harbin 150001, PR China.
Life sciences in space research
|April 26, 2024
概括
模拟长期太空飞行复合应激 (LSCS) 改变海马基因表达,影响PI3K-Akt和MAPK通路. 一个具有竞争力的内源性RNA网络揭示了关键的相互作用,其中Thrombospondins2被确定为一个关键的目标.
科学领域:
- 神经科学是一个神经科学.
- 分子生物学分子生物学
- 空间生物学 空间生物学
背景情况:
- 长期太空飞行复合应激 (LSCS) 对宇航员健康构成风险,特别是影响海马体,这是记忆和认知的关键大脑区域.
- 了解LSCS诱导的海马体变化背后的分子机制对于开发对策至关重要.
研究的目的:
- 系统地评估模拟LSCS对大鼠海马的转录效应.
- 阐明参与海马对LSCS反应的分子通路和基因调节网络.
主要方法:
- 全转录组测序是在暴露于模拟LSCS和对照条件的老鼠海马上进行的.
- 进行了差异表达分析,基因本体学 (GO) 和基因和基因组的京都百科全书 (KEGG) 路径丰富分析.
- 为了确定基因相互作用,构建了一个具有竞争力的内源RNA (ceRNA) 网络.
主要成果:
- 在LSCS组中观察到信使RNAs (mRNAs),长非编码RNAs (lncRNAs),圆形RNAs (circRNAs) 和微RNAs (miRNAs) 的显著变化.
- 确定PI3K-Akt和MAPK信号通路在LSCS病变发生过程中可能至关重要.
- 构建了一个复杂的ceRNA网络,涉及220个miRNA-mRNA,76个miRNA-lncRNA和44个miRNA-circRNA对,突出了Thrombospondins2作为一个关键目标.
结论:
- 这项研究提供了海马体对模拟LSCS的反应的第一个全面的转录组分析.
- 这些发现揭示了对LSCS背后的分子机制和基因调节网络的新见解,包括一个重要的ceRNA网络.
- 已确定的途径和目标为未来研究减轻太空飞行的神经效应提供了基础.
