基于Coix lacryma-jobi L.的大规模标记物发展的高密度遗传图的构建,使用特定位置放大片段测序 (slaf-seq)
Chenglong Yang1,2, Xiuwen Ban1,2, Mingqiang Zhou1,2
1Guizhou Institute of Subtropical Crops, Guizhou Academy of Agricultural Sciences, Xingyi, 542600, Guizhou, People's Republic of China.
Scientific reports
|April 26, 2024
概括
研究人员使用SLAF测序开发了首个Coix lacryma-jobi L.,也称为乔布的眼的高密度遗传图. 这张地图有助于为这一重要的作物发现基因和进行分子育种.
科学领域:
- 植物遗传学 植物遗传学
- 基因组学就是基因组学.
- 农业科学 农业科学
背景情况:
- Coix lacryma-jobi L. (乔布的眼) 是一种有价值的作物,具有重要的经济和药用意义.
- 开发遗传资源对于改善其种植和利用至关重要.
研究的目的:
- 为Coix lacryma-jobi.构建第一个高密度的遗传链接地图.
- 为准确的基因映射和在约伯眼中的分子繁殖提供一个平台.
主要方法:
- 使用高通量测序和特定位置放大片段 (SLAF) 库构建.
- 分析了F2种群的数据,该数据来自"Qianyi No. 2"和"Wenyi No. 2"以及"Wenyi No. 2"和"Wenyi No. 2"以及"Wenyi No. 2"以及"Wenyi No. 3"以及"Wenyi No. 4"等. 2".这是一个很好的例子.
- 将3605个高质量的SLAF集成到十个遗传链接组中.
主要成果:
- 产生了一个高密度的遗传地图,跨越1620.39cM,平均标记距离为0.45cM.
- 识别了3605个高质量的SLAF和3646个用于绘制地图的多态标记.
- 该地图由十个链接组组成,每个组平均有360.5个标记.
结论:
- 本研究介绍了使用SLAF-seq方法创建的Coix lacryma-jobi的第一个高密度遗传地图.
- 该地图促进了精确的基因/定量特征位点 (QTL) 映射,基于地图的基因隔离和分子育种.
- 它显著提高了在约伯的眼中宝贵的遗传资源的发现和利用.
