病理学实验室档案:核酸和蛋白质的保存质量为NSCLC分子检测
Albino Eccher1, Davide Seminati2, Vincenzo L'Imperio2
1Department of Diagnostics and Public Health, University of Modena and Reggio Emilia, 41121 Modena, Italy.
Journal of personalized medicine
|April 27, 2024
概括
在分子诊断方面,正确储存甲固定嵌块 (FFPE) 是至关重要的. 这项研究揭示了FFPE档案中的DNA质量比RNA更快地降解,影响了瘤学研究.
科学领域:
- 病理学 病理学 病理学
- 分子生物学分子生物学
- 生物化学 生物化学
背景情况:
- 嵌入式甲固定式 (FFPE) 组织块对于诊断中的回顾性分子分析至关重要.
- 不适当的存储条件可能会损害FFPE标本内的核酸和蛋白质抗原的完整性.
- 确保存档的FFPE样本的质量对于可靠的分子测试和治疗见解至关重要.
研究的目的:
- 评估储存条件对非小细胞肺癌 (NSCLC) 病例中FFPE块质量的影响.
- 在各种存档条件下存储的FFPE样本中评估核酸 (DNA和RNA) 和蛋白质抗原的完整性.
- 为了确定FFPE块的最佳储存时间,以保持其分子完整性,用于诊断目的.
主要方法:
- 来自6个意大利病理档案的45个NSCLC病例的FFPE块的分析,具有不同的环境条件.
- 使用分子技术评估核酸的数量和质量.
- 使用免疫组织化学和MALDI-MSI (矩阵辅助激光溶解/电离质谱成像) 评估蛋白质抗原完整性.
主要成果:
- 在94.4%的样本中,DNA数量适合分子分析,但质量仅在62.3%中是最佳的.
- 所有样本的RNA数量都足够,但只有22.3%的样本具有最佳质量.
- 在6-8年后,DNA质量明显恶化,而RNA质量在10年后下降. 蛋白质抗原强度和蛋白质组信号也随着储存时间的延长而下降.
结论:
- 在长期储存期间,FFPE块中的DNA比RNA更容易降解.
- 存档时间对核酸和蛋白质的质量产生重大影响,影响分子分析的适用性.
- 优先考虑适当的FFPE存档条件和治理对于保持样本完整性和优化瘤学预测测试至关重要.
